RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.89■■□□□ 1.1
TMCO3-201ENST00000375391 ASB7Q9H672 318 aa21.89■■□□□ 1.1
TMCO3-201ENST00000375391 CNTN3Q9P232 1028 aa21.89■■□□□ 1.1
TMCO3-201ENST00000375391 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.89■■□□□ 1.1
TMCO3-201ENST00000375391 SLC24A5Q71RS6 500 aa21.89■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 USP37Q86T82 979 aa21.89■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 BAP1Q92560 729 aa21.89■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 HCSTQ9UBK5 93 aa21.89■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 CHD7Q9P2D1 2997 aa21.89■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.89■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 GTF2H1P32780 548 aa21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 KRT9P35527 623 aa21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 ZBTB6Q15916 424 aa21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 SEPT8Q92599 483 aa21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 SCN1AP35498 2009 aa21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 FAM170AA1A519 330 aa21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 KIAA0355O15063 1070 aa21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 B4GALT3O60512 393 aa21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF623O75123 536 aa21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 DPP3Q9NY33 737 aa21.88■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 LRRC53A6NM62 1247 aa21.87■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 MFAP3LO75121 409 aa21.87■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 CALCAP01258 141 aa21.87■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 XKR4Q5GH76 650 aa21.87■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.87■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 HELQQ8TDG4 1101 aa21.87■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.87■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 RSAD1Q9HA92 442 aa21.87■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 ACP6Q9NPH0 428 aa21.87■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 CAPN11Q9UMQ6 739 aa21.87■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.093e-7■■■□□ 18.8
TMCO3-201ENST00000375391 F8W810 466 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 UPP2O95045 317 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 ARID5AQ03989 594 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 KYAT1Q16773 422 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 BADQ92934 168 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 GPR88Q9GZN0 384 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 STX10O60499 249 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 TNNC2P02585 160 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 EPHB4P54760 987 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 NAB2Q15742 525 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 LRRC8AQ8IWT6 810 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 IMPACTQ9P2X3 320 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 POLIQ9UNA4 740 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 C2CD2Q9Y426 696 aa21.86■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 P4HA2O15460 535 aa21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 FAM189BP81408 668 aa21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 SURF1Q15526 300 aa21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 ABHD10Q9NUJ1 306 aa21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 TTC3P53804 2025 aa21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 PMM2O15305 246 aa21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 OFD1O75665 1012 aa21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 CETN1Q12798 172 aa21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 MFSD5Q6N075 450 aa21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 WDR59Q6PJI9 974 aa21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 CHP1Q99653 195 aa21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.84■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 SKILP12757 684 aa21.84■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 KCNE1P15382 129 aa21.84■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 ENPEPQ07075 957 aa21.84■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 TRPC3Q13507 836 aa21.84■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.84■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 RAP1GAPP47736 663 aa21.83■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 RAB27AP51159 221 aa21.83■■□□□ 1.09
TMCO3-201ENST00000375391 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms