RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365375.1

RNU6-728P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 728, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-728P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-728P-201ENST00000365375 GPD1P21695 349 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 PCSK1P29120 753 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 GRIA3P42263 894 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 ALDH1A3P47895 512 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 SLC6A9P48067 706 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 TCEA2Q15560 299 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 ADRM1Q16186 407 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 NFE2L2Q16236 605 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 UGT8Q16880 541 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 FCRLBQ6BAA4 426 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF529Q6P280 563 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 CNNM4Q6P4Q7 775 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 COLGALT2Q8IYK4 626 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 PQLC1Q8N2U9 271 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 STON2Q8WXE9 905 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZBTB9Q96C00 473 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 LDAHQ9H6V9 325 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 CPNE5Q9HCH3 593 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 MOCS1Q9NZB8 636 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 DPP7Q9UHL4 492 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 NOTCH4Q99466 2003 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 TRGV11A0A075B6L2 103 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 A0A1W2PS29 197 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 WDR27A2RRH5 827 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 CCDC151A5D8V7 595 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 TRIM38O00635 465 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 YY2O15391 372 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 BPIP17213 487 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 ENPP1P22413 925 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 GATA3P23771 443 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 ECHS1P30084 290 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 SOX10P56693 466 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 IL2P60568 153 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 CDK17Q00537 523 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 SEPT2Q15019 361 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 GPR162Q16538 588 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 TSTD2Q5T7W7 516 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 KAZNQ674X7 775 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 FOXR2Q6PJQ5 311 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 KCNK18Q7Z418 384 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 HOMEZQ8IX15 550 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 PPM1KQ8N3J5 372 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 VGLL2Q8N8G2 317 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 CLRN3Q8NCR9 226 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR2W6PQ8NHA6 318 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 NUP133Q8WUM0 1156 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 TFAP2BQ92481 460 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 MED15Q96RN5 788 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 PNKPQ96T60 521 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 LANCL2Q9NS86 450 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 ACTL7AQ9Y615 435 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 LINC01548A6NM66 108 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 ADM5C9JUS6 153 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 E9PSI1 815 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 RAB11FIP3O75154 756 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 IGKV2-30P06310 120 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 FCER1AP12319 257 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 CCT2P78371 535 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 ATP8B2P98198 1209 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 MTM1Q13496 603 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 SART3Q15020 963 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 PTPRRQ15256 657 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 LLGL1Q15334 1064 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 TXNRD1Q16881 649 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 NBPF8Q3BBV2 869 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 MTX3Q5HYI7 312 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF626Q68DY1 528 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 AMIGO2Q86SJ2 522 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 C11orf74Q86VG3 221 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 NIM1KQ8IY84 436 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 AHI1Q8N157 1196 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 FITM2Q8N6M3 262 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 LPIN2Q92539 896 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 RAX2Q96IS3 184 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 ACAP3Q96P50 834 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 ORAI2Q96SN7 254 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-728P-201ENST00000365375 GSTO2Q9H4Y5 243 aa2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms