RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANO3Q9BYT9 981 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDGFCQ9NRA1 345 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 SH3BP4Q9P0V3 963 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM83GA6ND36 823 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADAMTS3O15072 1205 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 SOCS5O75159 536 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRT37O76014 449 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 JTBO76095 146 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 URI1O94763 535 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 CRTAMO95727 393 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 TOMM40O96008 361 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERCC3P19447 782 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRT2P35908 639 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 CXCR3P49682 368 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 FLT3LGP49771 235 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCT8P50990 548 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAP2BP61225 183 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOXB2Q5VYV0 432 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF549Q6P9A3 640 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 LPIN2Q92539 896 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 WBP2Q969T9 261 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 C5orf34Q96MH7 638 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLITRK1Q96PX8 696 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRAIPQ9BWF2 469 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 BOCQ9BWV1 1114 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 BACH2Q9BYV9 841 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1W2PR48 441 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 DVL2O14641 736 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCDH8O95206 1070 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYP17A1P05093 508 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 RHCEP18577 417 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 EPHA7Q15375 998 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 OTOP1Q7RTM1 612 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 DRC7Q8IY82 874 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 C7orf31Q8N865 590 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDYL2Q8N8U2 506 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 REPS2Q8NFH8 660 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC30A5Q8TAD4 765 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 REPS1Q96D71 796 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAMK1GQ96NX5 476 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYL10Q9BUA6 226 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 POT1Q9NUX5 634 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRVI1Q9Y6F6 885 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYPNQ86TC9 1320 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 WDR17Q8IZU2 1322 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZBTB7CA1YPR0 619 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 WDR27A2RRH5 827 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 B4DGG1 531 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRAMEF4O60810 478 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRSS23O95084 383 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 APPP05067 770 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 EBLN1P0CF75 366 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSG1P11464 419 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 XPAP23025 273 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 HOXC13P31276 330 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 NRG3P56975 720 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 GABREP78334 506 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 MGAT5Q09328 741 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM47AQ5JRC9 791 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 LMBR1LQ6UX01 489 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIM3Q86V86 326 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 MCF2L2Q86YR7 1114 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 C8orf58Q8NAV2 365 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM125Q96AQ2 219 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 MED15Q96RN5 788 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 MEIS3Q99687 375 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM234AQ9H0X4 552 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCIF1Q9H4Z3 704 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 INTS13Q9NVM9 706 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPRC5DQ9NZD1 345 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSFX1Q9UBD0 423 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-170P-201ENST00000362832 VWC2LB2RUY7 222 aa1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms