RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ARID2Q68CP9 1835 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 RARAP10276 462 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 NF2P35240 595 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP24A1Q07973 514 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ACAD10Q6JQN1 1059 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 SV2AQ7L0J3 742 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 KIFAP3Q92845 792 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 TATDN2Q93075 761 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 BICD1Q96G01 975 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 RUNDC3BQ96NL0 473 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 GJB1P08034 283 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 RWDD2BP57060 319 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC29A2Q14542 456 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 CENPTQ96BT3 561 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 SEMA4AQ9H3S1 761 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 PLCB4Q15147 1175 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 QPCTQ16769 361 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ART4Q93070 314 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF302Q9NR11 478 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 PNMA2Q9UL42 364 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 MOGSQ13724 837 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 CHST13Q8NET6 341 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 PCYT2Q99447 389 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC19Q9H756 370 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 MCM3APO60318 1980 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 OTOFQ9HC10 1997 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 H0YHG0 523 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ENPEPQ07075 957 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 USP37Q86T82 979 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 CABS1Q96KC9 395 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 LCTP09848 1927 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 WNT7BP56706 349 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 MDM1Q8TC05 714 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM109Q9BVC6 243 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPRFP10586 1907 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNJ1P48048 391 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ACOT2P49753 483 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 GCNT1Q02742 428 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ERMARDQ5T6L9 678 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 HTTP42858 3142 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 FSCN2O14926 492 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 EDN1P05305 212 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 EMC2Q15006 297 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 GPD1LQ8N335 351 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 SLCO2A1Q92959 643 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 FGD4Q96M96 766 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 PASKQ96RG2 1323 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-201ENST00000357436 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-201ENST00000357436 RARGP13631 454 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-201ENST00000357436 GARTP22102 1010 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-201ENST00000357436 MMP13P45452 471 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms