RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM72Q6ZMU5 477 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 MCPH1Q8NEM0 835 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 GPRASP2Q96D09 838 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA1586Q9HCI6 787 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 CCNG2Q16589 344 aa24.02■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.02■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 GINM1Q9NU53 330 aa24.02■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 NINJ2Q9NZG7 142 aa24.02■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa24.02■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 H0YCG3 227 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 C21orf2O43822 256 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 APBA3O96018 575 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 NSFP46459 744 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
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HOXD1-201ENST00000331462 KATNAL2Q8IYT4 538 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 CKAP2Q8WWK9 683 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 ATP6V0A1Q93050 837 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 CEP170P1Q96L14 293 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 PI4K2AQ9BTU6 479 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 FOXP3Q9BZS1 431 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 ANAPC5Q9UJX4 755 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 ACTL7BQ9Y614 415 aa24.01■■□□□ 1.43
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HOXD1-201ENST00000331462 MAFGO15525 162 aa24■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF862O60290 1169 aa24■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 DGAT1O75907 488 aa24■■□□□ 1.43
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HOXD1-201ENST00000331462 ZACNQ401N2 412 aa24■■□□□ 1.43
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HOXD1-201ENST00000331462 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF516Q92618 1163 aa24■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 VCPIP1Q96JH7 1222 aa24■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 PLCD4Q9BRC7 762 aa24■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
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HOXD1-201ENST00000331462 EXTL3O43909 919 aa24■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 SLC8A1P32418 973 aa24■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 RIPK1Q13546 671 aa24■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa24■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 RHOT1Q8IXI2 618 aa24■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 DYDC1Q8WWB3 177 aa24■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 FAM212AQ96EL1 285 aa24■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 FAM213AQ9BRX8 229 aa24■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 THAP12O43422 761 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 FDX1P10109 184 aa23.99■■□□□ 1.43
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HOXD1-201ENST00000331462 NLRX1Q86UT6 975 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 VSIG10LQ86VR7 867 aa23.99■■□□□ 1.43
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HOXD1-201ENST00000331462 CCDC63Q8NA47 563 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 CPA5Q8WXQ8 436 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 SCLT1Q96NL6 688 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
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HOXD1-201ENST00000331462 ABCF3Q9NUQ8 709 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 EURLQ9NYK6 297 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 STYXL1Q9Y6J8 313 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 NFASCO94856 1347 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 TCP11X1B4DZS4 312 aa23.98■■□□□ 1.43
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HOXD1-201ENST00000331462 ABHD2P08910 425 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 RALAP11233 206 aa23.98■■□□□ 1.43
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HOXD1-201ENST00000331462 LLGL1Q15334 1064 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 LIN9Q5TKA1 542 aa23.98■■□□□ 1.43
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HOXD1-201ENST00000331462 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.98■■□□□ 1.43
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HOXD1-201ENST00000331462 GJB6O95452 261 aa23.98■■□□□ 1.43
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HOXD1-201ENST00000331462 CREB1P16220 341 aa23.98■■□□□ 1.43
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HOXD1-201ENST00000331462 WDR44Q5JSH3 913 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 EXD1Q8NHP7 514 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 ELMO3Q96BJ8 720 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 HLA-DRAP01903 254 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
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