RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 HASPINQ8TF76 798 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 RWDD2AQ9UIY3 292 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 TNNI1P19237 187 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 CYP3A5P20815 502 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 UPP1Q16831 310 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 SPATA1Q5VX52 437 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 FAM84AQ96KN4 292 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 ANO10Q9NW15 660 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 MARCH5Q9NX47 278 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 PODXLO00592 558 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 CSPG5O95196 566 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 KIF4AO95239 1232 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM191BP0C7N4 346 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 EPB41P11171 864 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 PLCB3Q01970 1234 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 STX1AQ16623 288 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 DPP3Q9NY33 737 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 PTPRJQ12913 1337 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 MAPK13O15264 365 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 GRM6O15303 877 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 TADA2AO75478 443 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 B3GAT3O94766 335 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
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HOXD4-201ENST00000306324 FOXR2Q6PJQ5 311 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 WDR49Q8IV35 697 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 SPPL3Q8TCT6 385 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 PARD3BQ8TEW8 1205 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 CGRRF1Q99675 332 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 MKNK1Q9BUB5 465 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 MTMR12Q9C0I1 747 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 INTS13Q9NVM9 706 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 ADAM28Q9UKQ2 775 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 KRT13P13646 458 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 TYRO3Q06418 890 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 OR5B17Q8NGF7 314 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 POF1BQ8WVV4 589 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 CEP63Q96MT8 703 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 SYCE3A1L190 88 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 LPXNO60711 386 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 TNNC2P02585 160 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 LRPAP1P30533 357 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 DLG4P78352 724 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 DUOXA2Q1HG44 320 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 USP37Q86T82 979 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 C3orf58Q8NDZ4 430 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 MED15Q96RN5 788 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 VWA8A3KMH1 1905 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJB1P25685 340 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 VAMP7P51809 220 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 UBE3AQ05086 875 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 BFSP1Q12934 665 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 C9orf57Q5W0N0 161 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 C1orf127Q8N9H9 656 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 TMC2Q8TDI7 906 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 LZTS1Q9Y250 596 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 NUB1Q9Y5A7 615 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 ITGB3P05106 788 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 KRT19P08727 400 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC40Q4G0X9 1142 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 FUT10Q6P4F1 479 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 VPS52Q8N1B4 723 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 VN1R3Q9BXE9 311 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJC25Q9H1X3 360 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 TLR9Q9NR96 1032 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 PPEF2O14830 753 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM49P0CI25 452 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM49CP0CI26 452 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC192P0DO97 292 aa24.13■■□□□ 1.45
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