RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 ABCB6Q9NP58 842 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 NCANO14594 1321 aa22.95■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 CEP350Q5VT06 3117 aa22.95■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 TMEM253P0C7T8 217 aa22.95■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 MFAP3P55082 362 aa22.95■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 PRKCZQ05513 592 aa22.95■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.95■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.95■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 TOMM70O94826 608 aa22.94■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 PSEN2P49810 448 aa22.94■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.94■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 ZMYND10O75800 440 aa22.94■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 CPT1AP50416 773 aa22.94■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 POU5F1BQ06416 359 aa22.94■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 CCDC181Q5TID7 509 aa22.94■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.94■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 CAPNS2Q96L46 248 aa22.94■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 FUT8Q9BYC5 575 aa22.94■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.94■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 WDR93Q6P2C0 686 aa22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 SLFN11Q7Z7L1 901 aa22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 HINFPQ9BQA5 517 aa22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 NRCAMQ92823 1304 aa22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 KIF4AO95239 1232 aa22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 CXCL8P10145 99 aa22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 PLA2G4AP47712 749 aa22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 NOGQ13253 232 aa22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 FAM187BQ17R55 369 aa22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 RFFLQ8WZ73 363 aa22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 COG5Q9UP83 839 aa22.93■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 HAS3O00219 553 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 TREHO43280 583 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 ZEB2O60315 1214 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 MMEP08473 750 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 AKR1A1P14550 325 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 TSPAN1O60635 241 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 PHACTR2O75167 634 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 CLSTN1O94985 981 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 CYP2C9P11712 490 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 CYBAP13498 195 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 FMO1Q01740 532 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 ITIH3Q06033 890 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 RPS6KA1Q15418 735 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 TRIP11Q15643 1979 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 PGK1P00558 417 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 WDR44Q5JSH3 913 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 ISCUQ9H1K1 167 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 ST7Q9NRC1 585 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 ANKRD62A6NC57 917 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 KCNK3O14649 394 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 ALDH1A1P00352 501 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 KRT5P13647 590 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 CYP11B1P15538 503 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 PAFAH1B1P43034 410 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 ADAM17P78536 824 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 NCOA4Q13772 614 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 DAAM2Q86T65 1068 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 WDR49Q8IV35 697 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 OSMRQ99650 979 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 GPR32O75388 356 aa22.9■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 GCNT1Q02742 428 aa22.9■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SOX17-201ENST00000297316 Q9Y3F1 56 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms