RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295083.7

PQLC3-201, Transcript of PQ loop repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PQLC3, Length 1,830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC3-201ENST00000295083 TLL1O43897 1013 aa26.71■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 TMEM191BP0C7N4 346 aa26.71■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 MAN2A1Q16706 1144 aa26.71■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 TDHQ8IZJ6 230 aa26.71■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 C1orf127Q8N9H9 656 aa26.71■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 TSPAN18Q96SJ8 248 aa26.71■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 DPP3Q9NY33 737 aa26.71■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 INSL6Q9Y581 213 aa26.71■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 LCHNA4D1U4 455 aa26.7■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 MYOGP15173 224 aa26.7■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 TPM4P67936 248 aa26.7■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 DSC1Q08554 894 aa26.7■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa26.7■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa26.7■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 CXorf38Q8TB03 319 aa26.7■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa26.7■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 SLC38A7Q9NVC3 462 aa26.7■■□□□ 1.87
PQLC3-201ENST00000295083 CASTOR2A6NHX0 329 aa26.69■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 LRRC43Q8N309 656 aa26.69■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa26.69■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 SIX4Q9UIU6 781 aa26.69■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 COPB1P53618 953 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 TUSC3Q13454 348 aa26.69■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 ZACNQ401N2 412 aa26.69■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 VWA3BQ502W6 1294 aa26.69■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 COLGALT2Q8IYK4 626 aa26.69■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 BEST2Q8NFU1 509 aa26.69■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 NDST4Q9H3R1 872 aa26.69■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 CWH43Q9H720 699 aa26.69■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 PPEF2O14830 753 aa26.68■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 LRRN2O75325 713 aa26.68■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 CST3P01034 146 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 TNNC2P02585 160 aa26.68■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 AFPP02771 609 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 ITGB3P05106 788 aa26.68■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 CYP3A5P20815 502 aa26.68■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 GTF2H1P32780 548 aa26.68■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 FMO5P49326 533 aa26.68■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 RSPH1Q8WYR4 309 aa26.68■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 TMEM8AQ9HCN3 771 aa26.68■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 GBF1Q92538 1859 aa26.68■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 SCN1AP35498 2009 aa26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 VNN1O95497 513 aa26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 PBX3P40426 434 aa26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 MXI1P50539 228 aa26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 CLCNKBP51801 687 aa26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 AP3M2P53677 418 aa26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 BIRC3Q13489 604 aa26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 F8W810 466 aa26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 PES1O00541 588 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 XPOTO43592 962 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 FANCCQ00597 558 aa26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 KRT39Q6A163 491 aa26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 TAS1R2Q8TE23 839 aa26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 ELMO3Q96BJ8 720 aa26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 STX10O60499 249 aa26.66■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 KRT19P08727 400 aa26.66■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 PBX2P40425 430 aa26.66■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 UPP1Q16831 310 aa26.66■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 C9orf57Q5W0N0 161 aa26.66■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 SZT2Q5T011 3432 aa26.66■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 ANO9A1A5B4 782 aa26.65■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 SERPINC1P01008 464 aa26.65■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 LRPAP1P30533 357 aa26.65■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 C3orf58Q8NDZ4 430 aa26.65■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 ITGA11Q9UKX5 1188 aa26.65■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 AGAP1Q9UPQ3 857 aa26.65■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 PHACTR2O75167 634 aa26.65■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 ARHGEF15O94989 841 aa26.65■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 LINC00271P0C7V0 271 aa26.65■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 SEMA4DQ92854 862 aa26.65■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 CRACR2AQ9BSW2 395 aa26.65■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
PQLC3-201ENST00000295083 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa26.64■■□□□ 1.85
PQLC3-201ENST00000295083 PIRO00625 290 aa26.64■■□□□ 1.85
PQLC3-201ENST00000295083 AP5Z1O43299 807 aa26.64■■□□□ 1.85
PQLC3-201ENST00000295083 OR1G1P47890 313 aa26.64■■□□□ 1.85
PQLC3-201ENST00000295083 SLC11A1P49279 550 aa26.64■■□□□ 1.85
PQLC3-201ENST00000295083 MYL7Q01449 175 aa26.64■■□□□ 1.85
PQLC3-201ENST00000295083 NCOA4Q13772 614 aa26.64■■□□□ 1.85
PQLC3-201ENST00000295083 FIBCD1Q8N539 461 aa26.64■■□□□ 1.85
PQLC3-201ENST00000295083 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
PQLC3-201ENST00000295083 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
PQLC3-201ENST00000295083 PODXLO00592 558 aa26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms