RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243893.10

UBE2C-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene UBE2C, Length 476 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-201ENST00000243893 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 LRRC43Q8N309 656 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 DPP3Q9NY33 737 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 CBFA2T2O43439 604 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 POMCP01189 267 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 UBASH3AP57075 661 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 BIRC3Q13489 604 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 UROC1Q96N76 676 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 COL4A6Q14031 1691 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 GATMP50440 423 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 NR1I3Q14994 352 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 SHHQ15465 462 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 CXorf38Q8TB03 319 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 IFNKQ9P0W0 207 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 ANO9A1A5B4 782 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 CARNS1A5YM72 827 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 PHACTR2O75167 634 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 CAPN15O75808 1086 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 RBP5P82980 135 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 EPC2Q52LR7 807 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 FAM84AQ96KN4 292 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 YME1L1Q96TA2 773 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 SIX4Q9UIU6 781 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 INSL6Q9Y581 213 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 PTPRSQ13332 1948 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 A0A1W2PQC6 194 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 VNN1O95497 513 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 HLA-DRAP01903 254 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 PAX3P23760 479 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 MRE11P49959 708 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 UBXN1Q04323 297 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 NCOA4Q13772 614 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 GBP6Q6ZN66 633 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 TAF4BQ92750 862 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 RAD9AQ99638 391 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 RAB20Q9NX57 234 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2C-201ENST00000243893 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 PIRO00625 290 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 AP5Z1O43299 807 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 DDHD2O94830 711 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 ITGB3P05106 788 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 ATICP31939 592 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 PNPLA4P41247 253 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 PIK3CAP42336 1068 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 GUCY2FP51841 1108 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 TRPC3Q13507 836 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 TRIM5Q9C035 493 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 PLCB2Q00722 1185 aa22■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 ZNF280BQ86YH2 543 aa22■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 LMO3Q8TAP4 145 aa22■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 FAXDC2Q96IV6 333 aa22■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 ZNF560Q96MR9 790 aa22■■□□□ 1.11
UBE2C-201ENST00000243893 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms