RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000189048.6

Tardbp-223, Transcript of TAR DNA-binding protein 43, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Tardbp, Length 1,096 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Col8a1	Q00780	744 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mageb5	Q14AN0	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Lrrfip1	Q3UZ39	729 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pls1	Q3V0K9	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Thrap3	Q569Z6	951 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm12253	Q5NC48	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Fstl4	Q5STE3	841 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Coil	Q5SU73	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ankrd40	Q5SUE8	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Dnajc8	Q6NZB0	253 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Frmd5	Q6P5H6	517 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mgat5b	Q765H6	792 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Dcaf5	Q80T85	946 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Dmrt3	Q80WT2	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Clasp2	Q8BRT1	1286 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tp53inp2	Q8CFU8	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Eif3b	Q8JZQ9	803 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Olfr868	Q8VFI8	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mogat1	Q91ZV4	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Trim59	Q922Y2	403 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Loxl4	Q924C6	757 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ubxn2a	Q99KJ0	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nwc	Q9CQI4	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Clec2g	Q9D676	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Triap1	Q9D8Z2	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sil1	Q9EPK6	465 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gucy1a3	Q9ERL9	691 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Aatf	Q9JKX4	526 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Jag1	Q9QXX0	1218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Aebp2	Q9Z248	504 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nin	Q61043	2035 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Brca1	P48754	1812 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tmem240	B2RWJ3	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048		H3BKT1	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ccer2	J3QPU5	274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Vmn1r170	K7N6W9	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm3591	K7N6X2	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Bdkrb2	P32299	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pld2	P97813	933 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Arhgap17	Q3UIA2	846 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rsad1	Q5SUV1	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sema4a	Q62178	760 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048		Q6GQU0	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Trpm4	Q7TN37	1213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Btla	Q7TSA3	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Lrfn4	Q80XU8	636 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Atg4d	Q8BGV9	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tmem74	Q8BQU7	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Bola3	Q8CEI1	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rfxap	Q8VCG9	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pcdhga11	Q91XY8	933 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pcdha2	Q91Y17	948 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Prdm9	Q96EQ9	843 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ankef1	Q9D2J7	775 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Jmjd6	Q9ERI5	403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pdc	Q9QW08	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Peak1	Q69Z38	1735 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ltn1	Q6A009	1767 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ankrd63	A2ARS0	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm12800	B1AUV4	484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ldlrad1	D3YYZ1	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Maml3	D4QGC2	1135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm8369	E9PZI3	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Top6bl	J3QMY9	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Prkcg	P63318	697 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sycp3	P70281	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ly9	Q01965	654 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Shcbp1l	Q3TTP0	639 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Snx33	Q4VAA7	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ehmt1	Q5DW34	1296 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mocs1	Q5RKZ7	636 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Dpf2	Q61103	391 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Kiaa1841	Q68FF0	718 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mpp4	Q6P7F1	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zfp341	Q6PGC9	846 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Luc7l2	Q7TNC4	392 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Asic4	Q7TNS7	539 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Vps37d	Q810I0	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	BC049730	Q810N3	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048		Q8BHB7	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rassf10	Q8BL43	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Fam126b	Q8C729	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Anln	Q8K298	1121 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Il23r	Q8K4B4	644 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Iqsec1	Q8R0S2	961 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Slc5a9	Q8VDT1	685 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zdhhc5	Q8VDZ4	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Lzts2	Q91YU6	671 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ssbp3	Q9D032	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tstd3	Q9D0B5	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pnkp	Q9JLV6	522 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Npas3	Q9QZQ0	925 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ubn2	Q80WC1	1314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ccdc88a	Q5SNZ0	1873 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rhox3f	A2ANE1	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pex10	B1AUE5	324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Olfr247	E9PVJ7	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Lmod3	E9QA62	571 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Dcdc2b	F7BCK0	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	4933406M09Rik	G3XA12	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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