RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm1758F6VZZ1 202 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mucl2P02815 138 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SpoplQ2M2N2 392 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp957Q3UT76 567 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ankrd6Q69ZU8 712 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adat2Q6P6J0 191 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf618Q80YY7 953 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sun2Q8BJS4 731 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zc3h6Q8BYK8 1177 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt5Q922U2 580 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SyncQ9EPM5 470 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sv2aQ9JIS5 742 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smim10l2aA0A0B4J1F8 78 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lekr1B2RVN1 116 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm8113E0CXS8 587 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r55G3UWZ4 781 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r53L7N473 806 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 UncxO08934 530 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kpna6O35345 536 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pou5f1P20263 352 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc11a2P49282 568 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RalaP63321 206 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Afap1l2Q5DTU0 825 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nlrp14Q6B966 993 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf168Q80XJ2 565 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Armc6Q8BNU0 468 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CtsfQ9R013 462 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pnpla6Q3TRM4 1355 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Uchl4P58321 233 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Elmo3Q8BYZ7 720 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mtmr6Q8VE11 617 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Anapc4Q91W96 807 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Peg12Q9WVA7 283 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mettl1Q9Z120 268 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Osbpl7A2A716 963 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ism1A2ATD1 454 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 G3bp2P97379 482 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vcpip1Q8CDG3 1220 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc35f6Q8VE96 372 aa13.54□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Robo1O89026 1612 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc16a6B1AT66 607 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppfia4B8QI36 1187 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nedd9O35177 833 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Xirp1O70373 1129 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Irf6P97431 467 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zbtb16Q3UQ17 673 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fdxacb1Q3UY23 622 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CybbQ61093 570 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Btnl9Q8BJE2 536 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sik2Q8CFH6 931 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Micu3Q9CTY5 523 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C5P06684 1680 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Heatr4E9Q357 955 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 OtoaQ8K561 1137 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AagabQ8R2R3 316 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc4bP0C192 709 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syt2P46097 422 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Git1Q68FF6 770 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc186Q8C9S4 917 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Parp10Q8CIE4 960 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stap2Q8R0L1 411 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrps22Q9CXW2 359 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9D937 123 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sh2b2Q9JID9 621 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cog1Q9Z160 980 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arfgef2A2A5R2 1792 aa13.53□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyth3O08967 399 aa13.52□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stmn1P54227 149 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eif3eP60229 445 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 InscQ3HNM7 579 aa13.52□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmc3Q7TQ69 1130 aa13.52□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kank2Q8BX02 843 aa13.52□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Actl9Q8CG27 415 aa13.52□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ranbp17Q99NF8 1088 aa13.52□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1700018B08RikQ9DA83 213 aa13.52□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pitpnm2Q6ZPQ6 1335 aa13.52□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aldh2P47738 519 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FAM120AQ6A0A9 1112 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stk38lQ7TSE6 464 aa13.52□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gtf2ird1Q9JI57 1104 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nme3Q9WV85 169 aa13.52□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdh18E9Q9Q6 790 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clcn6O35454 870 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IapP03975 557 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Yy1Q00899 414 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Skap2Q3UND0 358 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dph1Q5NCQ5 438 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myo6Q64331 1265 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RubcnQ80U62 956 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tdp1Q8BJ37 609 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grik4Q8BMF5 956 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ints9Q8K114 658 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 OafQ8QZR4 282 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 E2f4Q8R0K9 410 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Taf6lQ8R2K4 616 aa13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.9 ms