RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619644.4

SMTN-223, Transcript of smoothelin, human

TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-223	ENST00000619644	PLS3	P13797	630 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	FMO1	Q01740	532 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	UBE4B	O95155	1302 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644		H0YIN7	160 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	RARG	P13631	454 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	CTNNA2	P26232	953 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	COPS2	P61201	443 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	MTMR1	Q13613	665 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	CNGA2	Q16280	664 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	PLVAP	Q9BX97	442 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	COL20A1	Q9P218	1284 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	DENND3	A2RUS2	1198 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	RFX1	P22670	979 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	BLMH	Q13867	455 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	UGCG	Q16739	394 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	KIFAP3	Q92845	792 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	C9orf72	Q96LT7	481 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	PNMA3	Q9UL41	463 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	TMX2	Q9Y320	296 aa		15.43	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ABL2	P42684	1182 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	MSH2	P43246	934 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	KAZN	Q674X7	775 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	KCND2	Q9NZV8	630 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ITGA8	P53708	1063 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	BNIP1	Q12981	228 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	DLGAP5	Q15398	846 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	NFIL3	Q16649	462 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	KRT39	Q6A163	491 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		15.42	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	GH1	P01241	217 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ATF2	P15336	505 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	CNGA1	P29973	690 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	STX2	P32856	288 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	SUN1	O94901	812 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	BRAF	P15056	766 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ZNF365	Q70YC5	407 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ENTPD3	O75355	529 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	LINGO3	P0C6S8	592 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	OGFOD1	Q8N543	542 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	IFT74	Q96LB3	600 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	GAS8	O95995	478 aa		15.4	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	TNNI1	P19237	187 aa		15.4	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	RRM1	P23921	792 aa		15.4	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ATP11A	P98196	1134 aa		15.4	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	TAF11	Q15544	211 aa		15.4	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		15.4	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	ART4	Q93070	314 aa		15.4	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	RIT2	Q99578	217 aa		15.4	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	RAB20	Q9NX57	234 aa		15.4	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		15.4	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	KLHL33	A6NCF5	533 aa		15.4	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	GBP1	P32455	592 aa		15.4	■□□□□ 0.06
SMTN-223	ENST00000619644	CDR2	Q01850	454 aa		15.4	■□□□□ 0.06

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