RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.67■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 ARL5CA6NH57 179 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 VNN1O95497 513 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 FGFR1P11362 822 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 PBX1P40424 430 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 MLH1P40692 756 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 MRE11P49959 708 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 GATMP50440 423 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF75DP51815 510 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 GUCY2FP51841 1108 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 DEFB103AP81534 67 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 KCNMA1Q12791 1236 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 SURF1Q15526 300 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 SV2AQ7L0J3 742 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 WDR49Q8IV35 697 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 RSAD1Q9HA92 442 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 ZACNQ401N2 412 aa22.65■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 CD302Q8IX05 232 aa22.65■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.65■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 LMO3Q8TAP4 145 aa22.65■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 SEMA4DQ92854 862 aa22.65■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 PGBD4Q96DM1 585 aa22.65■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 FNBP1Q96RU3 617 aa22.65■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.65■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.65■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.65■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 SIX4Q9UIU6 781 aa22.65■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 PMM2O15305 246 aa22.64■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 B4GALT3O60512 393 aa22.64■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 TNNI1P19237 187 aa22.64■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 GTF2H1P32780 548 aa22.64■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 PLCB2Q00722 1185 aa22.64■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 EPC2Q52LR7 807 aa22.64■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.64■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 HELQQ8TDG4 1101 aa22.64■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 KIF12Q96FN5 646 aa22.64■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.64■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.64■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 DERAQ9Y315 318 aa22.64■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.64■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 C2CD2Q9Y426 696 aa22.64■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 FGBP02675 491 aa22.63■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 KLK7P49862 253 aa22.63■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 SCNN1GP51170 649 aa22.63■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.63■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.63■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.63■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 HACE1Q8IYU2 909 aa22.63■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.63■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.63■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.63■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 CASD1Q96PB1 797 aa22.63■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.63■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 TRIM5Q9C035 493 aa22.63■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 BAIAP3O94812 1187 aa22.62■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 MXI1P50539 228 aa22.62■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 MYL7Q01449 175 aa22.62■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 APBA1Q02410 837 aa22.62■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 UBXN1Q04323 297 aa22.62■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.62■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 KRT39Q6A163 491 aa22.62■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 TOP1MTQ969P6 601 aa22.62■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.62■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.62■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.62■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.62■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 PPEF2O14830 753 aa22.61■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 STX10O60499 249 aa22.61■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 ADCY5O95622 1261 aa22.61■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 SLC9A1P19634 815 aa22.61■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.61■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 HERVK_113Q902F9 699 aa22.61■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.61■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 SIX2Q9NPC8 291 aa22.61■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.61■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 P4HA2O15460 535 aa22.6■■□□□ 1.21
CSAG3-202ENST00000617158 HLA-DRAP01903 254 aa22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms