RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598960.5

FCHO1-227, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-227ENST00000598960 FAM212AQ96EL1 285 aa15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 C1orf112Q9NSG2 853 aa15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 TNNC2P02585 160 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 NFICP08651 508 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 ARHGAP44Q17R89 818 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 NYAP1Q6ZVC0 841 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 KAT5Q92993 513 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 FAM81BQ96LP2 452 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 CCDC42Q96M95 316 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 KREMEN1Q96MU8 473 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 DEF6Q9H4E7 631 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 ASB7Q9H672 318 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 STARD7Q9NQZ5 370 aa15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 LACTBL1A8MY62 500 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 DNM1LO00429 736 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 EVI5O60447 810 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 CAND2O75155 1236 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 PHACTR2O75167 634 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 GFPT2O94808 682 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 LCA5LO95447 670 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 CHRNA1P02708 482 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 ANXA13P27216 316 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 THPOP40225 353 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 MFAP3P55082 362 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 NOP14P78316 857 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 GCNT1Q02742 428 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 ARID5AQ03989 594 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 NCOA4Q13772 614 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 MTFR1Q15390 333 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 DUOXA2Q1HG44 320 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 WDR44Q5JSH3 913 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 UBXN11Q5T124 520 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 PPM1KQ8N3J5 372 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 SHC3Q92529 594 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 SNX27Q96L92 541 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 ACAP3Q96P50 834 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 PI4K2AQ9BTU6 479 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 NOD1Q9Y239 953 aa15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 AKR1B10O60218 316 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 RPS6KA5O75582 802 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 ASS1P00966 412 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 CCDC172P0C7W6 258 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 CCL5P13501 91 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 KRT83P78385 493 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 FAM26DQ5JW98 314 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 JADE1Q6IE81 842 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 NT5DC4Q86YG4 428 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 CD302Q8IX05 232 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 TATDN2Q93075 761 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 IMPG2Q9BZV3 1241 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 HAUS4Q9H6D7 363 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 C2CD2Q9Y426 696 aa15.23■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 ARVCFO00192 962 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF263O14978 683 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 RECQL4O94761 1208 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 PTK2Q05397 1052 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 TMEM132DQ14C87 1099 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 PTPN14Q15678 1187 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 FBXO47Q5MNV8 452 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 SPOPLQ6IQ16 392 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 OLIG1Q8TAK6 271 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 ELMO3Q96BJ8 720 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 DEFB118Q96PH6 123 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 SYT11Q9BT88 431 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 ERVK-5Q9HDB9 667 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 SNTG2Q9NY99 539 aa15.22■□□□□ 0.03
FCHO1-227ENST00000598960 OGDHLQ9ULD0 1010 aa15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms