RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM191BP0C7N4 346 aa33.51■■■□□ 2.96
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CAPNS1-206ENST00000588815 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa33.44■■■□□ 2.94
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CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
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CAPNS1-206ENST00000588815 FTHL17Q9BXU8 183 aa33.43■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 C11orf49Q9H6J7 331 aa33.43■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ITGA11Q9UKX5 1188 aa33.43■■■□□ 2.94
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