RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 NAB2Q15742 525 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 XKR4Q5GH76 650 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 KANK3Q6NY19 840 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 RDH13Q8NBN7 331 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 ENGASEQ8NFI3 743 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 HLA-CQ95604 372 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 SAAL1Q96ER3 474 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF12Q96FN5 646 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 B3GALT6Q96L58 329 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 SNX27Q96L92 541 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 VN1R3Q9BXE9 311 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM206Q9H813 350 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 EXOC1Q9NV70 894 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 CLDND1Q9NY35 253 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 STYXL1Q9Y6J8 313 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC26A0AVF1 554 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 FSCN2O14926 492 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.221e-5■□□□□ 8.6
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM189A1O60320 539 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 LDHAP00338 332 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 MYL1P05976 194 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNE1P15382 129 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 GARTP22102 1010 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 TIE1P35590 1138 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 BRCC3P46736 316 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM10P98175 930 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 EHHADHQ08426 723 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 DPYDQ12882 1025 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 MMRN1Q13201 1228 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAM15Q13444 863 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 KYAT1Q16773 422 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 ISM2Q6H9L7 571 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 JADE1Q6IE81 842 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 ARMCX5Q6P1M9 558 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP57Q86XR8 500 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 SCFD1Q8WVM8 642 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP2R3CQ969Q6 453 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 CBWD1Q9BRT8 395 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBP1Q9H171 429 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC38A7Q9NVC3 462 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 MARCH5Q9NX47 278 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 CNTN3Q9P232 1028 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 TRANK1O15050 2925 aa7.4□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 REV3LO60673 3130 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 I3L4J1 428 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 TGFB1I1O43294 461 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 NCK2O43639 380 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 B3GAT3O94766 335 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF4AO95239 1232 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 SOD2P04179 222 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 ADRB2P07550 413 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 CTSAP10619 480 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNA5P22460 613 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 KLRC2P26717 231 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL9P32969 192 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 LTBRP36941 435 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP2J2P51589 502 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 GUCY2FP51841 1108 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 CLUL1Q15846 466 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB6Q15916 424 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 UPP1Q16831 310 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 USP41Q3LFD5 358 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM171A1Q5VUB5 890 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 FUT10Q6P4F1 479 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms