RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588238.1

UBXN6-205, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

Gene UBXN6, Length 4,598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-205ENST00000588238 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 SOCS4Q8WXH5 440 aa15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 L2HGDHQ9H9P8 463 aa15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 SNX24Q9Y343 169 aa15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 ATRNO75882 1429 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 DCDC2CA8MYV0 355 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 SART1O43290 800 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 FGRP09769 529 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 AKR1A1P14550 325 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 CENPPQ6IPU0 288 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 TTC13Q8NBP0 860 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 FMO2Q99518 471 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 SEMA6BQ9H3T3 888 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 ABCC6O95255 1503 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 STILQ15468 1287 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 TLK2Q86UE8 772 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 VPS52Q8N1B4 723 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 TC2NQ8N9U0 490 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 ERGIC2Q96RQ1 377 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 REPS2Q8NFH8 660 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 SCYL1Q96KG9 808 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 OSBPL9Q96SU4 736 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-205ENST00000588238 NFKBIEO00221 500 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 B3GAT3O94766 335 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 CYP3A4P08684 503 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 BCAR1P56945 870 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 SEPT6Q14141 434 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 EFHC2Q5JST6 749 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 MPZL3Q6UWV2 235 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 LCMT1Q9UIC8 334 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 TRIM17Q9Y577 477 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 MRFAP1Q9Y605 127 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 GPR182O15218 404 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 CDH6P55285 790 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 SV2CQ496J9 727 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 TADA2BQ86TJ2 420 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 SLC51AQ86UW1 340 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 SH3BP5O60239 455 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 PDGFRAP16234 1089 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 GARTP22102 1010 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 PCSK1P29120 753 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 VSIG1Q86XK7 387 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 GARSP41250 739 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 CDK17Q00537 523 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 ADCY1Q08828 1119 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 BTNL9Q6UXG8 535 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 OLFML3Q9NRN5 406 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 SLC8A2Q9UPR5 921 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 DPYSL4O14531 572 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 GRIK4Q16099 956 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 AKAP3O75969 853 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 APOEP02649 317 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 TAF6P49848 677 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 KCNK18Q7Z418 384 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 TINF2Q9BSI4 451 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 SPON2Q9BUD6 331 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 NFU1Q9UMS0 254 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 SLCO1A2P46721 670 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 FAF2Q96CS3 445 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 A0A087X0B3 334 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 PODXLO00592 558 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 FKBP1BP68106 108 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 PLCB4Q15147 1175 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 RAD9BQ6WBX8 426 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 PPP4R1Q8TF05 950 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 DNAJB3Q8WWF6 145 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 CPB2Q96IY4 423 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 MTMR9Q96QG7 549 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 KPNA6O60684 536 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 GTF2H1P32780 548 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 TAP1Q03518 808 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 RAPH1Q70E73 1250 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN6-205ENST00000588238 COPS5Q92905 334 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms