RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 GALTP07902 379 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 PFKFB1P16118 471 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 CMA1P23946 247 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 GRM5P41594 1212 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 SYKP43405 635 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 SLC11A1P49279 550 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 PLCB3Q01970 1234 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 E2F4Q16254 413 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 PLPP4Q5VZY2 271 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 ZPBP2Q6X784 338 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 FSIP1Q8NA03 581 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 DNAJC19Q96DA6 116 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 ACAP3Q96P50 834 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 ACCSQ96QU6 501 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 TCF25Q9BQ70 676 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 TRIM9Q9C026 710 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 BLZF1Q9H2G9 400 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 MIOSQ9NXC5 875 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.5□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 CASTOR2A6NHX0 329 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 NRP1O14786 923 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 ADRB1P08588 477 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 DNAJB1P25685 340 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 NRIP1P48552 1158 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 GTF2BQ00403 316 aa8.49□□□□□ -1.05
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SMG6-211ENST00000572369 TUSC3Q13454 348 aa8.49□□□□□ -1.05
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SMG6-211ENST00000572369 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 KYAT1Q16773 422 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 SEZ6Q53EL9 994 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 GLRA4Q5JXX5 417 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 ZNF720Q7Z2F6 126 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 VPS52Q8N1B4 723 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 CEP120Q8N960 986 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 HVCN1Q96D96 273 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 FAM212AQ96EL1 285 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 IGSF21Q96ID5 467 aa8.49□□□□□ -1.05
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SMG6-211ENST00000572369 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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SMG6-211ENST00000572369 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 CLDND1Q9NY35 253 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 STK39Q9UEW8 545 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 USP25Q9UHP3 1055 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 LZTS1Q9Y250 596 aa8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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SMG6-211ENST00000572369 A0A1W2PQ64 194 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 A0A1W2PQD8 194 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 OGTO15294 1046 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 INPPL1O15357 1258 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 NCK2O43639 380 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 B4GALT3O60512 393 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 TADA2AO75478 443 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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SMG6-211ENST00000572369 CLTAP09496 248 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 SLFN14P0C7P3 912 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 MYBP10242 640 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 PROZP22891 400 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 CASP1P29466 404 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 NDUFA8P51970 172 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 ERVFC1P60507 584 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 MCL1Q07820 350 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 POSTNQ15063 836 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 KIAA1841Q6NSI8 718 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SMG6-211ENST00000572369 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa8.48□□□□□ -1.05
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