RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF174Q15697 407 aa4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 B3GNT9Q6UX72 402 aa4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 C1QL2Q7Z5L3 287 aa4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 SPICE1Q8N0Z3 855 aa4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 SLC35G2Q8TBE7 412 aa4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 E2F7Q96AV8 911 aa4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 ARL8AQ96BM9 186 aa4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 RUNDC1Q96C34 613 aa4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 TIFAQ96CG3 184 aa4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 EVI5LQ96CN4 794 aa4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 MAML3Q96JK9 1138 aa4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 MAF1Q9H063 256 aa4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 ANLNQ9NQW6 1124 aa4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 GOLGA8AA7E2F4 631 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 C1RP00736 705 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 HRGP04196 525 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 CYP17A1P05093 508 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM132BQ14DG7 1078 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 RALBP1Q15311 655 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 COBLL1Q53SF7 1204 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 FRMD7Q6ZUT3 714 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 AMOTL1Q8IY63 956 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 ZZZ3Q8IYH5 903 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 DYDC2Q96IM9 177 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 ACAP3Q96P50 834 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 NDC1Q9BTX1 674 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 OSBPL6Q9BZF3 934 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 NMRK2Q9NPI5 230 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 ACSS2Q9NR19 701 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 PIPSLA2A3N6 862 aa4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 IL33O95760 270 aa4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 FGAP02671 866 aa4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 HK1P19367 917 aa4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 SCAND1P57086 179 aa4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 BLOC1S1P78537 153 aa4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 SLC6A3Q01959 620 aa4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 KRT72Q14CN4 511 aa4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 KRT40Q6A162 431 aa4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 IL31Q6EBC2 164 aa4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 KIAA1958Q8N8K9 716 aa4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 TAGLN3Q9UI15 199 aa4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-202ENST00000558300 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 DVL2O14641 736 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 APAF1O14727 1248 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 DAPK3O43293 454 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 HKR1P10072 659 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 PAX3P23760 479 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 ADKP55263 362 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 IRF9Q00978 393 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 GALEQ14376 348 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM95Q3KNT9 176 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 ATAT1Q5SQI0 421 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 DOK3Q7L591 496 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 MORC1Q86VD1 984 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 PPM1EQ8WY54 764 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 SLC9A6Q92581 669 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 GJA10Q969M2 543 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 TEKT5Q96M29 485 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 AKIP1Q9NQ31 210 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC189A1A4V9 331 aa4.57□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 XPOTO43592 962 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 HIP1RO75146 1068 aa4.57□□□□□ -1.68
TMOD3-202ENST00000558300 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms