RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555676.5

RBM23-216, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 4

Gene RBM23, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-216	ENST00000555676	ITGA4	P13612	1032 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	GSDMD	P57764	484 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	KRT17	Q04695	432 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	HVCN1	Q96D96	273 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	APOL6	Q9BWW8	343 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	FZD8	Q9H461	694 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	TLE6	Q9H808	572 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	IFNK	Q9P0W0	207 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676		A0A1B0GUA9	196 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	HIDE1	A8MVS5	230 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	AP5Z1	O43299	807 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	NPTXR	O95502	500 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	POMC	P01189	267 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	EDN1	P05305	212 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	PPM1A	P35813	382 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	NAMPT	P43490	491 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	SLC11A1	P49279	550 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	NR1I3	Q14994	352 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	NFIL3	Q16649	462 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	SFR1	Q86XK3	245 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	EFHB	Q8N7U6	833 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	URGCP	Q8TCY9	931 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	KCNN1	Q92952	543 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	IFT74	Q96LB3	600 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	GAD1	Q99259	594 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	TCF25	Q9BQ70	676 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	CD320	Q9NPF0	282 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	CLEC1B	Q9P126	229 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676		A0A1B0GTH6	734 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	ARL5C	A6NH57	179 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	CETN3	O15182	167 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	GCNT3	O95395	438 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	GLP2R	O95838	553 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	ATP1A3	P13637	1013 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	AKAP5	P24588	427 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	DUSP6	Q16828	381 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	DAW1	Q8N136	415 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	IQCD	Q96DY2	449 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	IGSF21	Q96ID5	467 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	ZFP42	Q96MM3	310 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	ACCS	Q96QU6	501 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	MUC3A	Q02505	3323 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	SFI1	A8K8P3	1242 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM23-216	ENST00000555676	N4BP3	O15049	544 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM23-216	ENST00000555676	NRDC	O43847	1150 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM23-216	ENST00000555676	PRKCB	P05771	671 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM23-216	ENST00000555676	MLH1	P40692	756 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM23-216	ENST00000555676	NDUFV1	P49821	464 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM23-216	ENST00000555676	SCNN1G	P51170	649 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM23-216	ENST00000555676	GTF2B	Q00403	316 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM23-216	ENST00000555676	MAPK7	Q13164	816 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM23-216	ENST00000555676	ADAM9	Q13443	819 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM23-216	ENST00000555676	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM23-216	ENST00000555676	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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