RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555653.1

MIS18BP1-211, Transcript of MIS18 binding protein 1, human

TSL 2

Gene MIS18BP1, Length 429 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RUNDC1	Q96C34	613 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	OBP2A	Q9NY56	170 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	XDH	P47989	1333 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CYP27B1	O15528	508 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PLIN1	O60240	522 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FAM20B	O75063	409 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PEX11B	O96011	259 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GNAL	P38405	381 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	NPEPPS	P55786	919 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RAMP2	O60895	175 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	STC2	O76061	302 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MYL1	P05976	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	IL2RB	P14784	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	EDNRB	P24530	442 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RGMA	Q96B86	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PRRX2	Q99811	253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ITGA10	O75578	1167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ADRA1B	P35368	520 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SREBF1	P36956	1147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GZMK	P49863	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SP140	Q13342	867 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SEPT2	Q15019	361 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FBXO41	Q8TF61	875 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	DPF2	Q92785	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ADCY6	O43306	1168 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GPR32	O75388	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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