RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 VPS52Q8N1B4 723 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF560Q96MR9 790 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DUX4Q9UBX2 424 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF75DP51815 510 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PTPAQ15257 358 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 IL31Q6EBC2 164 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KRT74Q7RTS7 529 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ERP27Q96DN0 273 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA33Q96N06 139 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 EHD4Q9H223 541 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ADAMTSL3P82987 1691 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM247A6NEH6 219 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PDLIM1O00151 329 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CYP2B6P20813 491 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CASP2P42575 452 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MYL7Q01449 175 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SNX17Q15036 470 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC31Q6UY01 552 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KCTD1Q719H9 257 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ADCK1Q86TW2 530 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MLKLQ8NB16 471 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 IL17RAQ96F46 866 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 NDNQ99608 321 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ANO3Q9BYT9 981 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TEKT2Q9UIF3 430 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ATRNO75882 1429 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 FLT1P17948 1338 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MYO1FO00160 1098 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 OAZ1P54368 228 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 VBP1P61758 197 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MTMR2Q13614 643 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PM20D2Q8IYS1 436 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 LCORLQ8N3X6 602 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEC3Q8TD91 643 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TATDN2Q93075 761 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 NOD2Q9HC29 1040 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEB16A2A368 324 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PFKFB2O60825 505 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RPS6KA5O75582 802 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CALB1P05937 261 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ACADSP16219 412 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PPP4CP60510 307 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PAK2Q13177 524 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 COTL1Q14019 142 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PTK2BQ14289 1009 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MAPK6Q16659 721 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 HADHQ16836 314 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 VPS16Q9H269 839 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SPDYE2BA6NHP3 402 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 F5H6K3 240 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 AREL1O15033 823 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PGM3O95394 542 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SPDYE6P0CI01 402 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ITGAXP20702 1163 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KRT9P35527 623 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms