RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	PDE6C	P51160	858 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	CYP24A1	Q07973	514 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	SEC14L1	Q92503	715 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	ASB2	Q96Q27	587 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR88	Q9GZN0	384 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	EPC1	Q9H2F5	836 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	THEG	Q9P2T0	379 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	PARP14	Q460N5	1801 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	MYO9B	Q13459	2157 aa		12.69	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	PLXNB2	O15031	1838 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	NDC80	O14777	642 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	ERCC3	P19447	782 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	ARL2	P36404	184 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	CDR2	Q01850	454 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	PRKCE	Q02156	737 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	POU5F1B	Q06416	359 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	PPP3CA	Q08209	521 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	PLS1	Q14651	629 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	KYAT1	Q16773	422 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	IER5	Q5VY09	327 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	METTL7B	Q6UX53	244 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	FNBP1	Q96RU3	617 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	SH3GL2	Q99962	352 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	MROH8	Q9H579	483 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	TFR2	Q9UP52	801 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	RIPK3	Q9Y572	518 aa		12.68	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442		K7ERI5	159 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	KRIT1	O00522	736 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	CEP104	O60308	925 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	FTCD	O95954	541 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	CYP1A2	P05177	515 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	HOXC6	P09630	235 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM49	P0CI25	452 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM49C	P0CI26	452 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	ADSS	P30520	456 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	CHRNA3	P32297	505 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	LIG4	P49917	911 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	C2orf54	Q08AI8	447 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	PPM1E	Q8WY54	764 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	AZI2	Q9H6S1	392 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	MYH10	P35580	1976 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	RLF	Q13129	1914 aa		12.66	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		12.66	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF862	O60290	1169 aa		12.66	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	CTNNA2	P26232	953 aa		12.66	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	GCLM	P48507	274 aa		12.66	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	PTEN	P60484	403 aa		12.66	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
LETMD1-223	ENST00000550442	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38

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