RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 ZPBP2Q6X784 338 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 CPB2Q96IY4 423 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 CGRRF1Q99675 332 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 NCANO14594 1321 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 RTN2O75298 545 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 GPC5P78333 572 aa22.5■■□□□ 1.19
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PRDM4-205ENST00000550376 MESDQ14696 234 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 NAA35Q5VZE5 725 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM270Q6UE05 265 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 VTA1Q9NP79 307 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 AMFRQ9UKV5 643 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 GINS2Q9Y248 185 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.5■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 ERLIN1O75477 346 aa22.49■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 GCNT1Q02742 428 aa22.49■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 GRB14Q14449 540 aa22.49■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.49■■□□□ 1.19
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PRDM4-205ENST00000550376 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
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PRDM4-205ENST00000550376 ITGA4P13612 1032 aa22.49■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.49■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.49■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF394Q53GI3 561 aa22.49■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 USP38Q8NB14 1042 aa22.49■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 PPTC7Q8NI37 304 aa22.49■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 TINF2Q9BSI4 451 aa22.49■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
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PRDM4-205ENST00000550376 ALG6Q9Y672 507 aa22.49■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 FGFR4P22455 802 aa22.48■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 MARCKSL1P49006 195 aa22.48■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 SLC26A2P50443 739 aa22.48■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 MYL6P60660 151 aa22.48■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 ACVR2BQ13705 512 aa22.48■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 LLGL1Q15334 1064 aa22.48■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.48■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 C8orf74Q6P047 294 aa22.48■■□□□ 1.19
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PRDM4-205ENST00000550376 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.48■■□□□ 1.19
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PRDM4-205ENST00000550376 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.48■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.48■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM7Q9C029 511 aa22.48■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 FZD8Q9H461 694 aa22.48■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 NR2E1Q9Y466 385 aa22.48■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 OGTO15294 1046 aa22.47■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 ALG3Q92685 438 aa22.47■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 KRT35Q92764 455 aa22.47■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF653Q96CK0 615 aa22.47■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.47■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 PLXNB2O15031 1838 aa22.47■■□□□ 1.19
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PRDM4-205ENST00000550376 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 CXCL8P10145 99 aa22.47■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 MCL1Q07820 350 aa22.47■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 CASP8Q14790 479 aa22.47■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.47■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 KCNN1Q92952 543 aa22.47■■□□□ 1.19
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PRDM4-205ENST00000550376 NUP85Q9BW27 656 aa22.47■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.47■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.47■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 MAP2K7O14733 419 aa22.46■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 FKBP1BP68106 108 aa22.46■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.46■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.46■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.46■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.46■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 SETD4Q9NVD3 440 aa22.46■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 TFDP1Q14186 410 aa22.46■■□□□ 1.19
PRDM4-205ENST00000550376 CCL14Q16627 93 aa22.46■■□□□ 1.19
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