RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 CCDC113Q9H0I3 377 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 ERVK-5Q9HDB9 667 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 RGS18Q9NS28 235 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 FAM105AQ9NUU6 356 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 SLC38A7Q9NVC3 462 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 PARP2Q9UGN5 583 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 TPRP12270 2363 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 VPS13AQ96RL7 3174 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 ARHGEF37A1IGU5 675 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 PRR23AA6NEV1 266 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 FGFR4P22455 802 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 AVPR2P30518 371 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 AP3M2P53677 418 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 ZXDAP98168 799 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 MCL1Q07820 350 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 EHHADHQ08426 723 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 NFIL3Q16649 462 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 ANO6Q4KMQ2 910 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 LRSAM1Q6UWE0 723 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 NPAS4Q8IUM7 802 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 THNSL1Q8IYQ7 743 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 WNT8BQ93098 351 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 FAM212AQ96EL1 285 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 CTAGE1Q96RT6 745 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 TRAIPQ9BWF2 469 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 APOL6Q9BWW8 343 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 CDHR5Q9HBB8 845 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 AAASQ9NRG9 546 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 TMEM161AQ9NX61 479 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 HSPBP1Q9NZL4 362 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 GIT1Q9Y2X7 761 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-218ENST00000550159 ZFHX4Q86UP3 3567 aa10.46□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 A0A0U1RQF3 1178 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 CLIC2O15247 247 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 NBNO60934 754 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 PHACTR2O75167 634 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 PPP1R37O75864 691 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 TNNC2P02585 160 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 GRM5P41594 1212 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 CASP5P51878 434 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 COL19A1Q14993 1142 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 TCERG1LQ5VWI1 586 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 SPATA1Q5VX52 437 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 CENPPQ6IPU0 288 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 NT5DC4Q86YG4 428 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 SLC9A9Q8IVB4 645 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 C12orf56Q8IXR9 622 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 FAM186BQ8IYM0 893 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 TMEM40Q8WWA1 233 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 YME1L1Q96TA2 773 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 BPIFA3Q9BQP9 254 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 FAM213AQ9BRX8 229 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 MKNK1Q9BUB5 465 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 IMPG2Q9BZV3 1241 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 DNAJC25Q9H1X3 360 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 THAP9Q9H5L6 903 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 PDZD7Q9H5P4 517 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 MINDY3Q9H8M7 445 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 SCN5AQ14524 2016 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 A0A0B4J269 797 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 IKBKBO14920 756 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 MAPK13O15264 365 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 B4GALT5O43286 388 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 MBTPS2O43462 519 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 NCK2O43639 380 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 ZNF623O75123 536 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 TMEM191BP0C7N4 346 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 TNNI1P19237 187 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 LTBRP36941 435 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 STX17P56962 302 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 OSTNP61366 133 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 DPCR1Q3MIW9 517 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 FKBP15Q5T1M5 1219 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 FRMD5Q7Z6J6 570 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-218ENST00000550159 BEST2Q8NFU1 509 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms