RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	IFI44	Q8TCB0	444 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	MVB12A	Q96EY5	273 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	POLH	Q9Y253	713 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	DRGX	A6NNA5	263 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	FAM20B	O75063	409 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	ALAS1	P13196	640 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	INSRR	P14616	1297 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	SMARCA1	P28370	1054 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	CHN2	P52757	468 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	NHLH2	Q02577	135 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	GTF2H3	Q13889	308 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC157	Q569K6	752 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	MED25	Q71SY5	747 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	SYT12	Q8IV01	421 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	C3orf20	Q8ND61	904 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	HPS3	Q969F9	1004 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	AIFM3	Q96NN9	605 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	LEFTY2	O00292	366 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	GRM6	O15303	877 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	TLE1	Q04724	770 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	RABL3	Q5HYI8	236 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	DACT2	Q5SW24	774 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	RGMA	Q96B86	450 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	TRIM24	O15164	1050 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	SLC16A6	O15403	523 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	TSPAN6	O43657	245 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	ARIH2	O95376	493 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	ITGB1	P05556	798 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	CD1A	P06126	327 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	C1S	P09871	688 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	MAL	P21145	153 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	FITM2	Q8N6M3	262 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	CEP72	Q9P209	647 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	SBK3	P0C264	359 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	SLC6A2	P23975	617 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	MAP2K6	P52564	334 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	PTTG1IP	P53801	180 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	NOG	Q13253	232 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	FOXE3	Q13461	319 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	SNAPC2	Q13487	334 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	MLC1	Q15049	377 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	CDHR4	A6H8M9	788 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	DIRC3	C9JPN6	131 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-231	ENST00000544125	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48

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