RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADRB2P07550 413 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CXCL8P10145 99 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IL9P15248 144 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CREMQ03060 361 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UPP1Q16831 310 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIAA0319Q5VV43 1072 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKRD54Q6NXT1 300 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM87AQ8NBN3 555 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STAMQ92783 540 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MSTO1Q9BUK6 570 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RXFP1Q9HBX9 757 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DZANK1Q9NVP4 752 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CACNG4Q9UBN1 327 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRKAG3Q9UGI9 489 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 USP25Q9UHP3 1055 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HPSEQ9Y251 543 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C2orf16Q68DN1 1984 aa17.64■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TSC2P49815 1807 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADH1AP07327 375 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CNPP09543 421 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PFKFB1P16118 471 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CLCNKBP51801 687 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CASP5P51878 434 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ASIC1P78348 528 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RBM10P98175 930 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPP2R3AQ06190 1150 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SEZ6Q53EL9 994 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TAS1R1Q7RTX1 841 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CD302Q8IX05 232 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC22A17Q8WUG5 538 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KLHL5Q96PQ7 755 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ACCSQ96QU6 501 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM206Q9H813 350 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FNIP2Q9P278 1114 aa17.63■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MUC3AQ02505 3323 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BDP1A6H8Y1 2624 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A1W2PQ27 194 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A1W2PQ64 194 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A1W2PQD8 194 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKRD63C9JTQ0 380 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLFN14P0C7P3 912 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MYBP10242 640 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RPL9P32969 192 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TNFSF9P41273 254 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CLCN4P51793 760 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EHHADHQ08426 723 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POSTNQ15063 836 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CLUL1Q15846 466 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TPRNQ4KMQ1 711 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIAA1841Q6NSI8 718 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LLGL2Q6P1M3 1020 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PDXDC1Q6P996 788 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UNC13DQ70J99 1090 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CEP57L1Q8IYX8 460 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HASPINQ8TF76 798 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RABGGTAQ92696 567 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHAMP1Q96JM3 812 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TBC1D7Q9P0N9 293 aa17.62■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CUL9Q8IWT3 2517 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TNFRSF10AO00220 468 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PODXLO00592 558 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C2CD2LO14523 706 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 XPOTO43592 962 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRAPPC3O43617 180 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 B3GAT3O94766 335 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MYL1P05976 194 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CYP3A5P20815 502 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KCNA1Q09470 495 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZBTB6Q15916 424 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SYCE2Q6PIF2 218 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C3orf58Q8NDZ4 430 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PIK3R5Q8WYR1 880 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SUSD6Q92537 303 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TTPALQ9BTX7 342 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBE4BO95155 1302 aa17.61■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A1B0GVL5 298 aa17.6■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TISP43B9A030 160 aa17.6■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TEX28O15482 410 aa17.6■□□□□ 0.41
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GARTP22102 1010 aa17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms