RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 BEX3Q00994 111 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM32Q13049 653 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 C8orf74Q6P047 294 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 KAT5Q92993 513 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLPH3Q9H4A6 298 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 F2P00734 622 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 HTRA3P83110 453 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 SP3Q02447 781 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 PPFIA1Q13136 1202 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 GRIK4Q16099 956 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 SV2AQ7L0J3 742 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 SHC3Q92529 594 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 ACBD3Q9H3P7 528 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAH12Q6ZR08 3092 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 CYBAP13498 195 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 SLFN12LQ6IEE8 588 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
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PACSIN3-211ENST00000539589 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 96.1
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF186Q9NXI6 227 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 TAS2R14Q9NYV8 317 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 STIM2Q9P246 746 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGEB2O15479 319 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 TRPA1O75762 1119 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 OAS2P29728 719 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 PALB2Q86YC2 1186 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 HELQQ8TDG4 1101 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 ISCUQ9H1K1 167 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 VIPAS39Q9H9C1 493 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 OSGEPQ9NPF4 335 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 SETD4Q9NVD3 440 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 AMFRQ9UKV5 643 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 Q9Y3F1 56 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 EFNA5P52803 228 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 NT5DC3Q86UY8 548 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 USP38Q8NB14 1042 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 ACTRT1Q8TDG2 376 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 THAP2Q9H0W7 228 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 MYADML2A6NDP7 307 aa21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP26A1O43174 497 aa21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 SGPL1O95470 568 aa21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 AKR1A1P14550 325 aa21.77■■□□□ 1.07
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PACSIN3-211ENST00000539589 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 VEGFBP49765 207 aa21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 PTENP60484 403 aa21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 HIC1Q14526 733 aa21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMD6Q15008 389 aa21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 RHOT2Q8IXI1 618 aa21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM81BQ96LP2 452 aa21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 FNBP1Q96RU3 617 aa21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 PDE11AQ9HCR9 933 aa21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 BRCA2P51587 3418 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ASAP2O43150 1006 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP104O60308 925 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 FTLP02792 175 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 VTNP04004 478 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKCBP05771 671 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 IQCF3P0C7M6 154 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 WNT7BP56706 349 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TNNC1P63316 161 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 CLDN10P78369 228 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC7A5Q01650 507 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TERF2Q15554 542 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 HES6Q96HZ4 224 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 HAS3O00219 553 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 RTN2O75298 545 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 LDHAP00338 332 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 GZMAP12544 262 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 CPT1AP50416 773 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 MFSD14CQ5VZR4 134 aa21.75■■□□□ 1.07
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