RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537007.5

MRPL48-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L48, human

TSL 3

Gene MRPL48, Length 287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL48-208	ENST00000537007	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	HMOX1	P09601	288 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF28	P17035	718 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MAK	P20794	623 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	IL13	P35225	146 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	RGS2	P41220	211 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF165	P49910	485 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CACNB3	P54284	484 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	APOBR	Q0VD83	1088 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PRR31	Q5SQ13	230 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TREML2	Q5T2D2	321 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	STK32C	Q86UX6	486 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TMEM192	Q8IY95	271 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FIBCD1	Q8N539	461 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	RUBCN	Q92622	972 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	USP6NL	Q92738	828 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF503	Q96F45	646 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	RTKN	Q9BST9	563 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	LRRC3	Q9BY71	257 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	UBP1	Q9NZI7	540 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007		R4GN57	208 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TNFRSF10C	O14798	259 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CYBA	P13498	195 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PAM	P19021	973 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	KLRK1	P26718	216 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CYP2C18	P33260	490 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CYP2C19	P33261	490 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MCM4	P33991	863 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PTPRO	Q16827	1216 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TNNI3K	Q59H18	835 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	DCAF15	Q66K64	600 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MIB1	Q86YT6	1006 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SEC14L1	Q92503	715 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	BRF1	Q92994	677 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	RUNDC1	Q96C34	613 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SHD	Q96IW2	340 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	HAUS7	Q99871	368 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ITPR3	Q14573	2671 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MYO7A	Q13402	2215 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SCN5A	Q14524	2016 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ITPR1	Q14643	2758 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ARHGAP6	O43182	974 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MBTPS2	O43462	519 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	RAMP2	O60895	175 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FUCA1	P04066	466 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	NTRK1	P04629	796 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	AR	P10275	920 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	IFNGR1	P15260	489 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	COMT	P21964	271 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	LTBR	P36941	435 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CRK	P46108	304 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	GIPR	P48546	466 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	IGBP1	P78318	339 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SHC2	P98077	582 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	NFATC3	Q12968	1075 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ANGPT1	Q15389	498 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87

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