RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 ANK1P16157 1881 aa23.9■■□□□ 1.42
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PTPRK-222ENST00000532751 CBWD1Q9BRT8 395 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRK-222ENST00000532751 FAM213AQ9BRX8 229 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRK-222ENST00000532751 PCIF1Q9H4Z3 704 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRK-222ENST00000532751 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.41
PTPRK-222ENST00000532751 DERAQ9Y315 318 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRK-222ENST00000532751 NUB1Q9Y5A7 615 aa23.85■■□□□ 1.41
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