RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 AXLP30530 894 aa23.74■■□□□ 1.39
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PACSIN3-209ENST00000532457 TRAF7Q6Q0C0 670 aa23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-209ENST00000532457 USP37Q86T82 979 aa23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-209ENST00000532457 ARHGEF19Q8IW93 802 aa23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-209ENST00000532457 EFCAB13Q8IY85 973 aa23.74■■□□□ 1.39
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PACSIN3-209ENST00000532457 USP38Q8NB14 1042 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-209ENST00000532457 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-209ENST00000532457 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
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