RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529172.1

PPP6R3-216, Transcript of protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, human

TSL 2

Gene PPP6R3, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP6R3-216	ENST00000529172	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	NTM	Q9P121	344 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	NRP1	O14786	923 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	TEX33	O43247	280 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	ADCY6	O43306	1168 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	TOX4	O94842	621 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	AMY1A	P04745	511 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	IL2RB	P14784	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	BRAF	P15056	766 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	BPIFB4	P59827	614 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	MTSS1	O43312	755 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	TNFSF4	P23510	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	CASP5	P51878	434 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	CTXN1	P60606	82 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	CREM	Q03060	361 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	MTM1	Q13496	603 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	CNGA2	Q16280	664 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	MDM1	Q8TC05	714 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	VPS11	Q9H270	941 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	USP19	O94966	1318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	POM121B	A6NF01	834 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	CD1A	P06126	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	FPR1	P21462	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	PCSK1	P29120	753 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	CSF2RB	P32927	897 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	GUCY1A2	P33402	732 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	STT3A	P46977	705 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	SP140	Q13342	867 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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