RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523263.1

VIRMA-208, Transcript of vir like m6A methyltransferase associated, human

TSL 3

Gene VIRMA, Length 609 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VIRMA-208	ENST00000523263	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
VIRMA-208	ENST00000523263	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		10.46	□□□□□ -0.73
VIRMA-208	ENST00000523263	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		10.46	□□□□□ -0.73
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
VIRMA-208	ENST00000523263	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
VIRMA-208	ENST00000523263	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		10.46	□□□□□ -0.73
VIRMA-208	ENST00000523263	PATJ	Q8NI35	1801 aa		10.46	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	TM4SF5	O14894	197 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	N4BP3	O15049	544 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	TRAPPC3	O43617	180 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	CHRNB1	P11230	501 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	PSMC3	P17980	439 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	PML	P29590	882 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	CXCL12	P48061	93 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	RARRES1	P49788	294 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	LONP2	Q86WA8	852 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	TPH2	Q8IWU9	490 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	ING5	Q8WYH8	240 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	FAM3C	Q92520	227 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	UROC1	Q96N76	676 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	ASB16	Q96NS5	453 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	BRD9	Q9H8M2	597 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	MAFF	Q9ULX9	164 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		10.45	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	HR	O43593	1189 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	LRG1	P02750	347 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	ATF2	P15336	505 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	CEBPB	P17676	345 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	CYP4A11	Q02928	519 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	PTGDR	Q13258	359 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	LEMD2	Q8NC56	503 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	HASPIN	Q8TF76	798 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	SMARCD2	Q92925	531 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	E2F7	Q96AV8	911 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	LOXL4	Q96JB6	756 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	GPR88	Q9GZN0	384 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	SNTG2	Q9NY99	539 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	COL4A3	Q01955	1670 aa		10.44	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	WDR27	A2RRH5	827 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	ACKR2	O00590	384 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	CPLX1	O14810	134 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	MARCH6	O60337	910 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	CDC45	O75419	566 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	RECQL4	O94761	1208 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	B3GAT3	O94766	335 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	ELF1	P32519	619 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	EPHA5	P54756	1037 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	ROR1	Q01973	937 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	LRRC32	Q14392	662 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	UPP1	Q16831	310 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	TPGS2	Q68CL5	300 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	VIT	Q6UXI7	678 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		10.43	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		10.42	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		10.42	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263		K7ESF4	209 aa		10.42	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	ARNTL	O00327	626 aa		10.42	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	SYN3	O14994	580 aa		10.42	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	XBP1	P17861	261 aa		10.42	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	GDI1	P31150	447 aa		10.42	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	SATB1	Q01826	763 aa		10.42	□□□□□ -0.74
VIRMA-208	ENST00000523263	DMWD	Q09019	674 aa		10.42	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms