RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 AKT3Q9Y243 479 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 UBE4BO95155 1302 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 MYH11P35749 1972 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 LTBP1Q14766 1721 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 MYO1FO00160 1098 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA0754O94854 1291 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TUBBP07437 444 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TNNC1P63316 161 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PPATQ06203 517 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SNCBQ16143 134 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 BMT2Q1RMZ1 405 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GPD1LQ8N335 351 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TSC22D3Q99576 134 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ABCB6Q9NP58 842 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PGAP2Q9UHJ9 254 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 STAM2O75886 525 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CD19P15391 556 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GALCP54803 685 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 VSNL1P62760 191 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PPP3CAQ08209 521 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FSTL1Q12841 308 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 MAPK7Q13164 816 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SLMAPQ14BN4 828 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SYCE1Q8N0S2 351 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 DNERQ8NFT8 737 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SLC35B4Q969S0 331 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 KRT12Q99456 494 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CORO1BQ9BR76 489 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 YIPF3Q9GZM5 350 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PDE11AQ9HCR9 933 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF112Q9UJU3 913 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A27O95847 323 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CD58P19256 250 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF131P52739 623 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TTLL4Q14679 1199 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 MYBPC3Q14896 1274 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 MAPK6Q16659 721 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CCL15Q16663 113 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 C12orf42Q96LP6 360 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 AP1M1Q9BXS5 423 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GANQ9H2C0 597 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 KRIT1O00522 736 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CXCL11O14625 94 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 COPB2P35606 906 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM62Q0P6H9 643 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 NAB2Q15742 525 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 EPC2Q52LR7 807 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 C10orf76Q5T2E6 689 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA4Q8NEY3 305 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF653Q96CK0 615 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ACP6Q9NPH0 428 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RPTORQ8N122 1335 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CCT5P48643 541 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GUCY2DQ02846 1103 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PLCB4Q15147 1175 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 HGSNATQ68CP4 663 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FAAH2Q6GMR7 532 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FOXR2Q6PJQ5 311 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 HOOK3Q86VS8 718 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RIOX2Q8IUF8 465 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 C2orf69Q8N8R5 385 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 WHAMMQ8TF30 809 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.37□□□□□ -1.07
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