RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.12■□□□□ 0.97
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SH3BP2-220ENST00000511663 GPR152Q8TDT2 470 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2-220ENST00000511663 SHDQ96IW2 340 aa21.12■□□□□ 0.97
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SH3BP2-220ENST00000511663 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
SH3BP2-220ENST00000511663 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.06■□□□□ 0.96
SH3BP2-220ENST00000511663 ITFG1Q8TB96 612 aa21.06■□□□□ 0.96
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SH3BP2-220ENST00000511663 PLIN2Q99541 437 aa21.06■□□□□ 0.96
SH3BP2-220ENST00000511663 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
SH3BP2-220ENST00000511663 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
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