RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510801.5

COPS4-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 4, human

TSL 5

Gene COPS4, Length 381 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS4-208	ENST00000510801	LRPAP1	P30533	357 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	SYK	P43405	635 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	GLUD2	P49448	558 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	CASP5	P51878	434 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	ASIC1	P78348	528 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	PAGE5	Q96GU1	130 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	C2CD2	Q9Y426	696 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	MYO7A	Q13402	2215 aa		13.57	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801		A0A1B0GVL5	298 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	KLRC4	O43908	158 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	TADA2A	O75478	443 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	KIF4A	O95239	1232 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	UROD	P06132	367 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	MYB	P10242	640 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	NDUFA8	P51970	172 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	KCNA1	Q09470	495 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	PSMD2	Q13200	908 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	STAM	Q92783	540 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	CASP10	Q92851	521 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	CD207	Q9UJ71	328 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		13.56	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801		F8W810	466 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	PER2	O15055	1255 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	LINC01565	O15544	149 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	B3GAT3	O94766	335 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	CXCL8	P10145	99 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	TNFSF9	P41273	254 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	NDUFV1	P49821	464 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	CLCNKB	P51801	687 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	OSTN	P61366	133 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	CUL4B	Q13620	913 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	SPATA1	Q5VX52	437 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	KANK3	Q6NY19	840 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	RTL10	Q7L3V2	364 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	SUSD6	Q92537	303 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	S1PR5	Q9H228	398 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	IGFLR1	Q9H665	355 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	DPP7	Q9UHL4	492 aa		13.55	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	MYH11	P35749	1972 aa		13.54	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	LACTBL1	A8MY62	500 aa		13.54	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	PODXL	O00592	558 aa		13.54	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	SYN3	O14994	580 aa		13.54	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	MBTPS2	O43462	519 aa		13.54	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	ZNF202	O95125	648 aa		13.54	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	IL18RAP	O95256	599 aa		13.54	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	ADH1A	P07327	375 aa		13.54	□□□□□ -0.24
COPS4-208	ENST00000510801	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24

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