RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 FIZ1Q96SL8 496 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 CNTN3Q9P232 1028 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 F8W810 466 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 KIF4AO95239 1232 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 CLCNKBP51801 687 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 ASIC1P78348 528 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 NAB2Q15742 525 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 ADALQ6DHV7 355 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 CD302Q8IX05 232 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 TTPALQ9BTX7 342 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM206Q9H813 350 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 CHST7Q9NS84 486 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A0B4J269 797 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 LILRB3O75022 631 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 ITIH3Q06033 890 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 UPP1Q16831 310 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 GJD3Q8N144 294 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM212AQ96EL1 285 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM9Q9C026 710 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 EFEMP2O95967 443 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 CXCL8P10145 99 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 CMA1P23946 247 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 USP25Q9UHP3 1055 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 PODXLO00592 558 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 CITO14578 2027 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 TEX28O15482 410 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 GLUD1P00367 558 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 EPCAMP16422 314 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 CLCN4P51793 760 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 KIF12Q96FN5 646 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 B3GALT6Q96L58 329 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 FBXL18Q96ME1 805 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 APOL5Q9BWW9 433 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 FNIP2Q9P278 1114 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP1R37O75864 691 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 TNFSF9P41273 254 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIP11Q15643 1979 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 TTC26A0AVF1 554 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 LACTBL1A8MY62 500 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 C1RP00736 705 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 SLFN14P0C7P3 912 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 MYBP10242 640 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 MTHFRP42898 656 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 AFMP43652 599 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 PALB2Q86YC2 1186 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 STRA6Q9BX79 667 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 S1PR5Q9H228 398 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1B0GVL5 298 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 CYP3A5P20815 502 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 ACOT2P49753 483 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-210ENST00000505941 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms