RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 ARIH2O95376 493 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 MALP21145 153 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 PCSK1P29120 753 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 GZMKP49863 264 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 CACNB3P54284 484 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 PPP2CBP62714 309 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 PPP2CAP67775 309 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 FAM193AP78312 1265 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 SNAPC2Q13487 334 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 RIN1Q13671 783 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 NFYCQ13952 458 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 FGL2Q14314 439 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 ATP2B3Q16720 1220 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 AFMIDQ63HM1 303 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 IFI44Q8TCB0 444 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 PARD3BQ8TEW8 1205 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM176AQ96HP8 235 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 MRGPRX4Q96LA9 322 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 SAMD11Q96NU1 681 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 NT5C1BQ96P26 610 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 PNPOQ9NVS9 261 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 HDAC5Q9UQL6 1122 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF536O15090 1300 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 SOGA1O94964 1423 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 A0A088AWK7 358 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 GOLIM4O00461 696 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 PMM2O15305 246 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 TEX33O43247 280 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 MGEA5O60502 916 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 CR2P20023 1033 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 GUCY1A2P33402 732 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 ALDH1A3P47895 512 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 CTSWP56202 376 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 PTH1RQ03431 593 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 TLE1Q04724 770 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 MTM1Q13496 603 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 PLS1Q14651 629 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 FAM214AQ32MH5 1076 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 MFSD14BQ5SR56 506 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 SP8Q8IXZ3 490 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 PLBD2Q8NHP8 589 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 CFHR4Q92496 578 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 PMM1Q92871 262 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 CEP95Q96GE4 821 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 C20orf173Q96LM9 149 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 RPS6KC1Q96S38 1066 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 BHMT2Q9H2M3 363 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 OAZ3Q9UMX2 235 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 L1RE1Q9UN81 338 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 TSPOAP1O95153 1857 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1W2PPL8 197 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 STC2O76061 302 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 HRGP04196 525 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 CD1AP06126 327 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 TYRP14679 529 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 PHKG2P15735 406 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 BMP7P18075 431 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 ATP5JP18859 108 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 HOXA5P20719 270 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 PEX2P28328 305 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 CTXN1P60606 82 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 RAP2BP61225 183 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 RAB1AP62820 205 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 ADAM8P78325 824 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 GPSM2P81274 684 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 SP140Q13342 867 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 FAM47AQ5JRC9 791 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 FAM111BQ6SJ93 734 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 MAEAQ7L5Y9 396 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 TAX1BP1Q86VP1 789 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 FAM43AQ8N2R8 423 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 LRTOMTQ8WZ04 291 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 FAM167AQ96KS9 214 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-215ENST00000498054 MYOCQ99972 504 aa5.37□□□□□ -1.55
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