RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 EXTL3O43909 919 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 KIF20AO95235 890 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 LDHAP00338 332 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 CA8P35219 290 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 IRS1P35568 1242 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 CAMK1Q14012 370 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 CAMK4Q16566 473 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 TIGD5Q53EQ6 642 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 GPD1LQ8N335 351 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 LZTS1Q9Y250 596 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 COL6A3P12111 3177 aa21.51■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 KIF4AO95239 1232 aa21.51■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 CLCNKBP51801 687 aa21.51■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 ERVFC1P60507 584 aa21.51■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 ISM2Q6H9L7 571 aa21.51■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 JADE1Q6IE81 842 aa21.51■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 SPATA20Q8TB22 786 aa21.51■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 TCF25Q9BQ70 676 aa21.51■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 NFICP08651 508 aa21.5■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 BRSK2Q8IWQ3 736 aa21.5■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 CD302Q8IX05 232 aa21.5■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 VPS52Q8N1B4 723 aa21.5■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.5■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 GOLGA5Q8TBA6 731 aa21.5■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 UROC1Q96N76 676 aa21.5■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.5■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.5■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.5■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.5■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 TADA2AO75478 443 aa21.49■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 GUCY2FP51841 1108 aa21.49■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM132DQ14C87 1099 aa21.49■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 TMC7Q7Z402 723 aa21.49■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 CBWD2Q8IUF1 395 aa21.49■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 BIN1O00499 593 aa21.48■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 PODXLO00592 558 aa21.48■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 XPOTO43592 962 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 IL18RAPO95256 599 aa21.48■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 ADRB2P07550 413 aa21.48■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 WNT7BP56706 349 aa21.48■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 UPP1Q16831 310 aa21.48■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 TCEAL5Q5H9L2 206 aa21.48■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 FUT10Q6P4F1 479 aa21.48■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 XXYLT1Q8NBI6 393 aa21.48■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 RDH13Q8NBN7 331 aa21.48■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.48■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 ZBP1Q9H171 429 aa21.48■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.48■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 ASB7Q9H672 318 aa21.48■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF233A6NK53 670 aa21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 PDXKO00764 312 aa21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 FSCN2O14926 492 aa21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 CALUO43852 315 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 EXOC3O60645 756 aa21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 B3GAT3O94766 335 aa21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 NR3C1P04150 777 aa21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 PRCPP42785 496 aa21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 C12orf56Q8IXR9 622 aa21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 BEST2Q8NFU1 509 aa21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 DERAQ9Y315 318 aa21.47■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 SOD2P04179 222 aa21.46■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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HLA-B-255ENST00000498007 ZBTB6Q15916 424 aa21.46■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa21.46■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 TAS1R1Q7RTX1 841 aa21.46■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 GPT2Q8TD30 523 aa21.46■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 B3GALT6Q96L58 329 aa21.46■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 TSPAN18Q96SJ8 248 aa21.46■■□□□ 1.03
HLA-B-255ENST00000498007 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.46■■□□□ 1.03
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