RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.09□□□□□ -1.43
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.05□□□□□ -1.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.05□□□□□ -1.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GAGE12BA1L429 117 aa6.04□□□□□ -1.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.04□□□□□ -1.44
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGBP1P78318 339 aa6.04□□□□□ -1.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM240Q5SV17 173 aa6.04□□□□□ -1.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DACT2Q5SW24 774 aa6.04□□□□□ -1.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.04□□□□□ -1.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.04□□□□□ -1.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KAT5Q92993 513 aa6.04□□□□□ -1.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.04□□□□□ -1.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.04□□□□□ -1.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.04□□□□□ -1.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TDP1Q9NUW8 608 aa6.04□□□□□ -1.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.03□□□□□ -1.44
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