RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 FPGSQ05932 587 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 POU5F1BQ06416 359 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 RNF146Q9NTX7 359 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 ODF2LQ9ULJ1 636 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 KCNK3O14649 394 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 BACH1O14867 736 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 GPR37L1O60883 481 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 CCNE2O96020 404 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 YWHABP31946 246 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 STAT1P42224 750 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 GCLMP48507 274 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 ZNF131P52739 623 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 KCNC3Q14003 757 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 PGM5Q15124 567 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 SCN5AQ14524 2016 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 MYL7Q01449 175 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 C8orf74Q6P047 294 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 HAUS6Q7Z4H7 955 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 KLHL7Q8IXQ5 586 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 CCDC127Q96BQ5 260 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 FAM84AQ96KN4 292 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 ANK1P16157 1881 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 IVLP07476 585 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 H2AFZP0C0S5 128 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 RARBP10826 455 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 KRT13P13646 458 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 MUTP22033 750 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 BFSP1Q12934 665 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 MAP9Q49MG5 647 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 CFAP221Q4G0U5 840 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 H2AFVQ71UI9 128 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 VPS36Q86VN1 386 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 NME8Q8N427 588 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 TMEM199Q8N511 208 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 IFT81Q8WYA0 676 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 TAF4BQ92750 862 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 GPRASP2Q96D09 838 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 SAAL1Q96ER3 474 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 SELENOOQ9BVL4 669 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 TSKSQ9UJT2 592 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 MAFFQ9ULX9 164 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 MCM3APO60318 1980 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 CEP104O60308 925 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 TUBBP07437 444 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 GPNMBQ14956 572 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 RPS6KA1Q15418 735 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 PALB2Q86YC2 1186 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 KRT12Q99456 494 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 PRRX2Q99811 253 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 PXMP2Q9NR77 195 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 USP20Q9Y2K6 914 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 CCDC189A1A4V9 331 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 F8VZ95 297 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 NR3C2P08235 984 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 PRLRP16471 622 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 SOX5P35711 763 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 GALCP54803 685 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 FAM189BP81408 668 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 ARHGAP1Q07960 439 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 PPP3CAQ08209 521 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 MMGT1Q8N4V1 131 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 KAT5Q92993 513 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 ACP6Q9NPH0 428 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 DMAC2Q9NW81 257 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 IRAK4Q9NWZ3 460 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 PROB1E7EW31 1015 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC4-211ENST00000492996 FERP16591 822 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms