RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 ENKD1Q9H0I2 346 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 IL23AQ9NPF7 189 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 F2RL2O00254 374 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 SLC26A4O43511 780 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 RAP2AP10114 183 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 FPR1P21462 350 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 PRIM2P49643 509 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRC-212ENST00000491302 GRAMD1BQ3KR37 738 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRC-212ENST00000491302 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
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PTPRC-212ENST00000491302 EMC10Q5UCC4 262 aa9.43□□□□□ -0.9
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PTPRC-212ENST00000491302 RAC3P60763 192 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 KRT72Q14CN4 511 aa9.42□□□□□ -0.9
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PTPRC-212ENST00000491302 SEM1Q6ZVN7 128 aa9.42□□□□□ -0.9
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PTPRC-212ENST00000491302 STARD7Q9NQZ5 370 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 CORO2BQ9UQ03 480 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 ZMYM3Q14202 1370 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 USP19O94966 1318 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 PJA2O43164 708 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 B4GALT4O60513 344 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 NPR1P16066 1061 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 EN2P19622 333 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
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PTPRC-212ENST00000491302 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 ARL8AQ96BM9 186 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 MRGPRX1Q96LB2 322 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 TCF25Q9BQ70 676 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 EPC1Q9H2F5 836 aa9.41□□□□□ -0.9
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PTPRC-212ENST00000491302 RIN1Q13671 783 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 AOPEPQ8N6M6 819 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 SHCBP1Q8NEM2 672 aa9.4□□□□□ -0.9
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PTPRC-212ENST00000491302 CFHR4Q92496 578 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 CEP95Q96GE4 821 aa9.4□□□□□ -0.9
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PTPRC-212ENST00000491302 MRI1Q9BV20 369 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 PACSIN1Q9BY11 444 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 KCNH6Q9H252 994 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRC-212ENST00000491302 RLIMQ9NVW2 624 aa9.4□□□□□ -0.9
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