RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	ELP1	O95163	1332 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A087WWV3	80 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP6R2	O75170	966 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARIH2	O95376	493 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC25A27	O95847	323 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPHX1	P07099	455 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD247	P20963	164 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITGB7	P26010	798 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	INHBE	P58166	350 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOG	Q13253	232 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q4G0T1	1027 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRR16	Q569H4	304 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	RESP18	Q5W5W9	173 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MFSD4A	Q8N468	514 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	JMY	Q8N9B5	988 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	RMDN3	Q96TC7	470 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	GP6	Q9HCN6	339 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	VAV3	Q9UKW4	847 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	LCT	P09848	1927 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1B0GVL5	298 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PQ27	194 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PQ64	194 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PQD8	194 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOXN1	O15353	648 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADCY6	O43306	1168 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSMD10	O75832	226 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCNE2	O96020	404 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEACAM5	P06731	702 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR52Z1	P0C646	297 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADORA2A	P29274	412 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFA8	P51970	172 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHMP4BP1	P59074	171 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	C1QTNF8	P60827	252 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRB14	Q14449	540 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	STK38	Q15208	465 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCL14	Q16627	93 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEP55	Q53EZ4	464 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAL	Q6DHV7	355 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNK18	Q7Z418	384 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC5A5	Q92911	643 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	GBP4	Q96PP9	640 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MMP19	Q99542	508 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MROH8	Q9H579	483 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	JADE2	Q9NQC1	790 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	WHRN	Q9P202	907 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CFAP45	Q9UL16	551 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	GABRQ	Q9UN88	632 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		6.91	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		6.9	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		6.9	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEMF	O60524	1076 aa		6.9	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CUTA	O60888	179 aa		6.9	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CBX7	O95931	251 aa		6.9	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAPNS1	P04632	268 aa		6.9	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	FURIN	P09958	794 aa		6.9	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOSL1	P15407	271 aa		6.9	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PFKFB1	P16118	471 aa		6.9	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNA2	P16389	499 aa		6.9	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CMA1	P23946	247 aa		6.9	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP2K2	P36507	400 aa		6.9	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRPH	P41219	470 aa		6.9	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	TXK	P42681	527 aa		6.9	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ME1	P48163	572 aa		6.9	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2H	P62256	183 aa		6.9	□□□□□ -1.3

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