RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 SASS6Q6UVJ0 657 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 SFR1Q86XK3 245 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 METTL13Q8N6R0 699 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 TRIML1Q8N9V2 468 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 TCP11Q8WWU5 503 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 DNAJC19Q96DA6 116 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 IFT74Q96LB3 600 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 SCLT1Q96NL6 688 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 GSDMAQ96QA5 445 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 ANP32EQ9BTT0 268 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 GPRC5CQ9NQ84 441 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 SETD4Q9NVD3 440 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 PANK4Q9NVE7 773 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 MAN1B1Q9UKM7 699 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 FRMD3A2A2Y4 597 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 LINC01387J3KSC0 135 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 K7ENM7 598 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 DYRK3O43781 588 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 KLRC4O43908 158 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 RHOBTB3O94955 611 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 SGPL1O95470 568 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 CCDC192P0DO97 292 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 CYP2C9P11712 490 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 PLS3P13797 630 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 CAPN2P17655 700 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 KLRC1P26715 233 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 TMOD1P28289 359 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 CDC25BP30305 580 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 HOXC8P31273 242 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 GJA8P48165 433 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF131P52739 623 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 SOX10P56693 466 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 RTP1P59025 263 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 ITGA7Q13683 1181 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 ODR4Q5SWX8 454 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 NT5DC1Q5TFE4 455 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 TAF2Q6P1X5 1199 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 SESTD1Q86VW0 696 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 DAW1Q8N136 415 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 MYCT1Q8N699 235 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 SPATA20Q8TB22 786 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 PMEPA1Q969W9 287 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 TP53INP1Q96A56 240 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM143Q96AN5 459 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 ZBTB10Q96DT7 871 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 CEP89Q96ST8 783 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 C17orf75Q9HAS0 396 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 AKT3Q9Y243 479 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 LRRIQ4A6NIV6 560 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 H0YCG3 227 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 NOS3P29474 1203 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 NAMPTP43490 491 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 DRP2Q13474 957 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 STIM1Q13586 685 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 ALCAMQ13740 583 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 MORC3Q14149 939 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 TFDP1Q14186 410 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 MARCH8Q5T0T0 291 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 EFCAB12Q6NXP0 572 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 RSPH3Q86UC2 560 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 FAM178BQ8IXR5 827 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 SLC17A8Q8NDX2 589 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 DEPTORQ8TB45 409 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 BSNDQ8WZ55 320 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 NLRP4Q96MN2 994 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-218ENST00000487565 OLFML3Q9NRN5 406 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms