RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 DUSP10Q9Y6W6 482 aa11.19□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 ANO9A1A5B4 782 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 BTNL10A8MVZ5 291 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 HAS3O00219 553 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 PHACTR2O75167 634 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 MOCS3O95396 460 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 MYL3P08590 195 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 MCF2P10911 925 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TNFAIP3P21580 790 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 USP8P40818 1118 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TNFSF9P41273 254 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CDC42EP1Q00587 391 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 GCNT1Q02742 428 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 AMHR2Q16671 573 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 KYAT1Q16773 422 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SEZ6Q53EL9 994 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 NFRKBQ6P4R8 1299 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC30A5Q8TAD4 765 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 OLIG1Q8TAK6 271 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 KAT5Q92993 513 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R16BQ96T49 567 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 AGPAT1Q99943 283 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CDT1Q9H211 546 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CDC23Q9UJX2 597 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 INTUQ9ULD6 942 aa11.18□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 KPNA6O60684 536 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 ERLIN2O94905 339 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 IL18RAPO95256 599 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC34A2O95436 690 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 VNN1O95497 513 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 H2AFZP0C0S5 128 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 IQCF3P0C7M6 154 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CYBAP13498 195 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CHMP4BP1P59074 171 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 AMPD2Q01433 879 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 H2AFVQ71UI9 128 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 THNSL1Q8IYQ7 743 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TRPV1Q8NER1 839 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 OR5B17Q8NGF7 314 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TATDN2Q93075 761 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM84AQ96KN4 292 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 PI4K2AQ9BTU6 479 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CARD6Q9BX69 1037 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 PACSIN1Q9BY11 444 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 PDZD7Q9H5P4 517 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa11.17□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 B4GALT4O60513 344 aa11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TSPAN1O60635 241 aa11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CLTAP09496 248 aa11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP2C9P11712 490 aa11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 BEX3Q00994 111 aa11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 NCOA4Q13772 614 aa11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 DUOXA2Q1HG44 320 aa11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 GLYCTKQ8IVS8 523 aa11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CEP112Q8N8E3 955 aa11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM212AQ96EL1 285 aa11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 IMPG2Q9BZV3 1241 aa11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 ADAMTS10Q9H324 1103 aa11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 JRKLQ9Y4A0 524 aa11.16□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 NCANO14594 1321 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 C17orf102A2RUQ5 167 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 EFCAB8A8MWE9 144 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP26A1O43174 497 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 BUB1O43683 1085 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TADA3O75528 432 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TNNC2P02585 160 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM191BP0C7N4 346 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM253P0C7T8 217 aa11.15□□□□□ -0.62
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