RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482651.5

HDGF-208, Transcript of heparin binding growth factor, human

TSL 3

Gene HDGF, Length 966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDGF-208	ENST00000482651	STK39	Q9UEW8	545 aa		9.64	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	9.64	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	9.64	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651		A0A1B0GUA9	196 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	PP2D1	A8MPX8	630 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	B4GALT3	O60512	393 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	CUTA	O60888	179 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	DDHD2	O94830	711 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	NPTXR	O95502	500 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	POMC	P01189	267 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	WEE1	P30291	646 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	MLH1	P40692	756 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	ZP2	Q05996	745 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	KCNC3	Q14003	757 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	VPS52	Q8N1B4	723 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	CALML4	Q96GE6	196 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	IFT74	Q96LB3	600 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	DNM3	Q9UQ16	869 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	HES2	Q9Y543	173 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		9.63	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	ARL5C	A6NH57	179 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651		E9PMD0	336 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	ACKR2	O00590	384 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	NRP1	O14786	923 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	N4BP3	O15049	544 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	CXCL14	O95715	111 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	ALDH2	P05091	517 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	PRKCB	P05771	671 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	CTSA	P10619	480 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	CDC25A	P30304	524 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	SCNN1G	P51170	649 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	EFNA5	P52803	228 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	PTK2	Q05397	1052 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	GIT2	Q14161	759 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	PTPA	Q15257	358 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	MAPK6	Q16659	721 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	HYI	Q5T013	277 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	CASP10	Q92851	521 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	GAD1	Q99259	594 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	HINFP	Q9BQA5	517 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	APOL6	Q9BWW8	343 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	IRAK3	Q9Y616	596 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		9.62	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	ARID2	Q68CP9	1835 aa		9.61	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		9.61	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		9.61	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	HIP1R	O75146	1068 aa		9.61	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	UQCRH	P07919	91 aa		9.61	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	NPR3	P17342	541 aa		9.61	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	AKAP5	P24588	427 aa		9.61	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	CA8	P35219	290 aa		9.61	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	OR1G1	P47890	313 aa		9.61	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	DSC1	Q08554	894 aa		9.61	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	UVSSA	Q2YD98	709 aa		9.61	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		9.61	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		9.61	□□□□□ -0.87
HDGF-208	ENST00000482651	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		9.61	□□□□□ -0.87

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