RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 CHST7Q9NS84 486 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 USP25Q9UHP3 1055 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 TRIP11Q15643 1979 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 TTC26A0AVF1 554 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 FSD2A1L4K1 749 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 ADRB2P07550 413 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 CLCNKBP51801 687 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 UPP1Q16831 310 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 HASPINQ8TF76 798 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 UROC1Q96N76 676 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.83■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 SYKP43405 635 aa22.83■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 DSG1Q02413 1049 aa22.83■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.83■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.83■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 FSIP1Q8NA03 581 aa22.83■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 B3GALT6Q96L58 329 aa22.83■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ACTB-211ENST00000480301 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 LACTBL1A8MY62 500 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 URODP06132 367 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 CNPP09543 421 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 GLUD2P49448 558 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 POSTNQ15063 836 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 CLUL1Q15846 466 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 USP41Q3LFD5 358 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 TMEM206Q9H813 350 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 CD207Q9UJ71 328 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.243e-7■■□□□ 13.7
ACTB-211ENST00000480301 CITO14578 2027 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 C2CD2LO14523 706 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 KLRC4O43908 158 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 B3GAT3O94766 335 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 IL9P15248 144 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 HOXD13P35453 343 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 ACOT2P49753 483 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 SPAG1Q07617 926 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB6Q15916 424 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 GPR65Q8IYL9 337 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.81■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 VCANP13611 3396 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 PODXLO00592 558 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 RTP2Q5QGT7 225 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 CASP10Q92851 521 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 KIF12Q96FN5 646 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 A0A0C4DFX4 3053 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 TTC28Q96AY4 2481 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 DLL1O00548 723 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 MBTPS2O43462 519 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 EPCAMP16422 314 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 GARTP22102 1010 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 CD302Q8IX05 232 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.79■■□□□ 1.24
ACTB-211ENST00000480301 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
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