RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	SHC2	P98077	582 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	SATB1	Q01826	763 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	CYP4A11	Q02928	519 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	GRM2	Q14416	872 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	NAB2	Q15742	525 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	NPY5R	Q15761	445 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	IL31	Q6EBC2	164 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	HAS1	Q92839	578 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	SNTG2	Q9NY99	539 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ZNF197	O14709	1029 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	MARCH6	O60337	910 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	MICAL2	O94851	1124 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	SLITRK3	O94933	977 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	DEXI	O95424	95 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	LRG1	P02750	347 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	GDI1	P31150	447 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	FNTB	P49356	437 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	LIMK1	P53667	647 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	GAS6	Q14393	721 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	LONP2	Q86WA8	852 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	TPH2	Q8IWU9	490 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	KCNB2	Q92953	911 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ASB16	Q96NS5	453 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	IGF2R	P11717	2491 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	LAMA1	P25391	3075 aa		11.71	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	COL4A2	P08572	1712 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	TM4SF5	O14894	197 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	RECQL4	O94761	1208 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	B3GAT3	O94766	335 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	LYPLA2	O95372	231 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	PSMC3	P17980	439 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	RPS6KB1	P23443	525 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	ELF1	P32519	619 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	EVC	P57679	992 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	VIT	Q6UXI7	678 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	NEK8	Q86SG6	692 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	CORO1B	Q9BR76	489 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	SPEG	Q15772	3267 aa		11.7	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	WDR27	A2RRH5	827 aa		11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279		K7ESF4	209 aa		11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	PRRG1	O14668	218 aa		11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	N4BP3	O15049	544 aa		11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	TRAPPC3	O43617	180 aa		11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	ABLIM3	O94929	683 aa		11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	PROS1	P07225	676 aa		11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	CCNE1	P24864	410 aa		11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	ROR1	Q01973	937 aa		11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	PTGDR	Q13258	359 aa		11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	LRRC32	Q14392	662 aa		11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	FAM187B	Q17R55	369 aa		11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
APTX-222	ENST00000478279	CEP68	Q76N32	757 aa		11.69	□□□□□ -0.54

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