RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 TTC26A0AVF1 554 aa22.37■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.37■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 NDUFV1P49821 464 aa22.37■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 HYAL1Q12794 435 aa22.37■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 DUSP6Q16828 381 aa22.37■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.37■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.37■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
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IMP4-209ENST00000462357 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.36■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
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IMP4-209ENST00000462357 CASP5P51878 434 aa22.36■■□□□ 1.17
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IMP4-209ENST00000462357 UPP1Q16831 310 aa22.36■■□□□ 1.17
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IMP4-209ENST00000462357 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.36■■□□□ 1.17
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IMP4-209ENST00000462357 MARCH5Q9NX47 278 aa22.36■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.35■■□□□ 1.17
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IMP4-209ENST00000462357 KCNA1Q09470 495 aa22.35■■□□□ 1.17
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IMP4-209ENST00000462357 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
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IMP4-209ENST00000462357 TTPALQ9BTX7 342 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.35■■□□□ 1.17
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IMP4-209ENST00000462357 PER2O15055 1255 aa22.34■■□□□ 1.17
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IMP4-209ENST00000462357 TNFSF9P41273 254 aa22.34■■□□□ 1.17
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IMP4-209ENST00000462357 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.34■■□□□ 1.17
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IMP4-209ENST00000462357 RHOBTB3O94955 611 aa22.33■■□□□ 1.17
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IMP4-209ENST00000462357 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.33■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 CEP57Q86XR8 500 aa22.33■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
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IMP4-209ENST00000462357 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 GSDMAQ96QA5 445 aa22.33■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 CHST7Q9NS84 486 aa22.33■■□□□ 1.17
IMP4-209ENST00000462357 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
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IMP4-209ENST00000462357 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
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IMP4-209ENST00000462357 FNIP2Q9P278 1114 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-209ENST00000462357 COL6A3P12111 3177 aa22.32■■□□□ 1.16
IMP4-209ENST00000462357 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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IMP4-209ENST00000462357 LRPAP1P30533 357 aa22.31■■□□□ 1.16
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