RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 KYAT1Q16773 422 aa26.16■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 UPP1Q16831 310 aa26.16■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 CEP57Q86XR8 500 aa26.16■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 GPR65Q8IYL9 337 aa26.16■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 IQUBQ8NA54 791 aa26.16■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 STAMQ92783 540 aa26.16■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 FBXL18Q96ME1 805 aa26.16■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 TTPALQ9BTX7 342 aa26.16■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 MSTO1Q9BUK6 570 aa26.16■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 CUEDC2Q9H467 287 aa26.16■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa26.15■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 CXCL8P10145 99 aa26.15■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 BECN1Q14457 450 aa26.15■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 RTP2Q5QGT7 225 aa26.15■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 HVCN1Q96D96 273 aa26.15■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC27Q9C0I9 530 aa26.15■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 TNMDQ9H2S6 317 aa26.15■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 ADAM7Q9H2U9 754 aa26.15■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 PANK4Q9NVE7 773 aa26.15■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.15■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 ZDHHC9Q9Y397 364 aa26.15■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 A0A0B4J269 797 aa26.14■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 OGTO15294 1046 aa26.14■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 TNFSF9P41273 254 aa26.14■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 CREMQ03060 361 aa26.14■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 SLC39A4Q6P5W5 647 aa26.14■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa26.14■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 FAM13BQ9NYF5 915 aa26.14■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 FNIP2Q9P278 1114 aa26.14■■□□□ 1.78
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD63C9JTQ0 380 aa26.13■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 PODXLO00592 558 aa26.13■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 GLUD1P00367 558 aa26.13■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 RPL17P18621 184 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa26.13■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 KANK3Q6NY19 840 aa26.13■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 GLYCTKQ8IVS8 523 aa26.13■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC65Q8IXS2 484 aa26.13■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 OLFML3Q9NRN5 406 aa26.13■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 KBTBD4Q9NVX7 518 aa26.13■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 CDH22Q9UJ99 828 aa26.13■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 FRMD3A2A2Y4 597 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 TRAPPC3O43617 180 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 PPP1R37O75864 691 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 GCNT3O95395 438 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 AMPD3Q01432 767 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 PPP2R3AQ06190 1150 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 SLFN12LQ6IEE8 588 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 CD300LGQ6UXG3 332 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 PALB2Q86YC2 1186 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 C3orf58Q8NDZ4 430 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 PIK3R5Q8WYR1 880 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 RIPOR3Q96MK2 946 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 STRA6Q9BX79 667 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 SFXN1Q9H9B4 322 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 MAN1C1Q9NR34 630 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 DPP7Q9UHL4 492 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 EXOC7Q9UPT5 735 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa26.12■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 TTC26A0AVF1 554 aa26.11■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 TISP43B9A030 160 aa26.11■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 FAM189A1O60320 539 aa26.11■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 WEE2P0C1S8 567 aa26.11■■□□□ 1.77
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SMKR1-201ENST00000462322 SPAG1Q07617 926 aa26.11■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
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SMKR1-201ENST00000462322 RESP18Q5W5W9 173 aa26.11■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 ADALQ6DHV7 355 aa26.11■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 TMC5Q6UXY8 1006 aa26.11■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 KIF12Q96FN5 646 aa26.11■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 NECTIN4Q96NY8 510 aa26.11■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 ACCSQ96QU6 501 aa26.11■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 EPHX3Q9H6B9 360 aa26.11■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 LACTBL1A8MY62 500 aa26.1■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 I3L4J1 428 aa26.1■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 MYBP10242 640 aa26.1■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 FGFR3P22607 806 aa26.1■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 BRCC3P46736 316 aa26.1■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 KRT85P78386 507 aa26.1■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 ATAT1Q5SQI0 421 aa26.1■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 PDXDC1Q6P996 788 aa26.1■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SMKR1-201ENST00000462322 FAM212AQ96EL1 285 aa26.1■■□□□ 1.77
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